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水稻14-3-3蛋白家族的生物信息学分析
被引：25
作者：
金谷雷
汪旭升
朱军
机构：
[1] 浙江大学生物信息学研究所,浙江大学生物信息学研究所,浙江大学生物信息学研究所杭州,杭州,杭州
来源：
关键词：
水稻;
14-3-3蛋白;
基因家族;
进化分析;
基因结构;
D O I：
暂无
中图分类号：
S511 [稻];
学科分类号：
摘要：
通过隐马尔柯夫模型(HiddenMarkovModel,HMM),对粳稻(OryzasativaL.ssp.japonica)基因组的蛋白质数据库进行搜索,结果获得8个1433蛋白的同源序列,其中发现4个新基因。通过对所有粳稻的1433蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(ExpressionSequenceTags,ESTs)进一步比对,为1433蛋白找到了ESTs的证据。结果说明这些基因在水稻不同的处理和不同的部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异。蛋白质多序列联配分析结果表明,存在可能的功能多态位点。通过基因结构和染色体定位的分析,确认了水稻基因组中存在ε样和非ε样两类1433蛋白。此外,对目前植物中的1433家族作了初步的进化分析。
引用
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页码：726 / 732
页数：7
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