23S rRNA基因序列分析及其在细菌鉴别诊断中的应用

被引:11
作者
洪帮兴
江丽芳
胡玉山
方丹云
郭辉玉
机构
[1] 中山大学中山医学院微生物学教研室
基金
广东省自然科学基金;
关键词
23SrRNA; 同源性; 遗传学;
D O I
暂无
中图分类号
R346 [];
学科分类号
摘要
目的 研究细菌 2 3SrRNA基因序列的差异 ,为细菌鉴别诊断和相关研究提供科学依据。方法 设计合适的通用引物、寻找恰当的扩增条件扩增常见细菌的 2 3SrRNA基因片段。通过序列测定和运用生物信息学分析不同种属细菌 2 3SrRNA基因的保守序列、变异规律及菌株间种系进化关系。结果 扩增出常见引起食源性感染的 16属 (种 )细菌 2 3SrRNA基因片段。部分扩增产物进行了限制性酶切鉴定和序列测定。序列比较研究获得 2 1个 2 3SrRNA的通用保守序列 ,2 3SrRNA基因保守序列与变异区在种系间呈间隔分布 ,大量变异区呈“马赛克”式分布。种系间进化关系与 16SrRNA分析结果一致。结论  2 3SrRNA基因序列的分布规律为进行细菌的鉴别诊断及基因芯片的研制提供了重要的理论和实验基础
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