抗原肽与MHC分子相互作用的QSAR模型研究

被引：7

作者：

宋哲

刘涛

刘伟

朱鸣华

王晓钢

机构：

[1] 大连理工大学物理系大连理工大学高科技研究院

来源：

物理化学学报 | 2007年 / 02期

关键词：

CTL表位; 氨基酸结构描述符; 定量构效关系; 偏最小二乘法;

D O I：

暂无

中图分类号：

R392 [医学免疫学];

学科分类号：

100102 ;

摘要：

分别采用氨基酸序列及氨基酸结构描述符方法定量研究了短肽-MHC(majorhistocompatibilitycomplex)分子结合亲合力的定量构效关系(QSAR)模型,用这两个模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测,预测准确度分别达到66.8%和65.5%.采用了去除“劣点”方法检验模型的鲁棒性,结果证明两个模型都具有良好的鲁棒性.通过改变两个模型的参数,对氨基酸残基个数为8或10的CTL(cytotoxicyTlymphocyte)表位进行预测.

引用

页码：198 / 205

页数：8

共 6 条

[1] 一种鲁棒主成分分析(PCA)算法 [J].

王松 ;

夏绍玮 .

系统工程理论与实践, 1998, (01) :10-14+76

[2]

应用多元统计分析[M]. 北京大学出版社 , 高惠璇编著, 2005

[3]

Bhasin M,Raghava G.P.S. Vaccine . 2004

[4]

Hattotuwagama,C.K,Guan,P.P,Docytchinova,I.A,Zygouri,C,Flower,D.R. J.Mol.Graphics Modell . 2004

[5]

Doytchinova,I.A,Flower,D.R. Journal of Medicinal Chemistry . 2001

[6]

van der Bruggen,P,Zhang,Y,Chaux,P,Stroobant,V,Panichelli,C,Schultz,E.S,Chapiro,J,van der Eynde,B.J,Brasseur,F,Boon,T. Immunological Reviews . 2002

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