核酶对靶RNA的体外切割反应的计算机分析

我们用计算机分析了锤头结构核酶的体外切割反应。计算了反应中△Ｅｓ’，△Ｅｒ’和△Ｅ三种假设的能量变化，△Ｅｓ’是底物从最稳态转变为松弛状态所需要的能量，△Ｅｒ’是核酶从最稳态转变为松弛状态所需要的能量；△Ｅ是由松弛状态的核酶和底物相互作用时的能量降低。我们发现，△Ｅｓ’或△Ｅｒ’高则反应切割效率低，而△Ｅ则既与反应切割效率又与反应的最适温度有关。△Ｅｓ’，△Ｅｒ＇和△Ｅ可以根据核酶和废物的核苷酸序列进行计算，因此我们的模型可以用于核酶的设计。