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Fast algorithm for peptide sequencing by mass spectroscopy .2 Bartels C. Biomed. Environ. Mass Spectrom . 1990
串联质谱数据的从头解析与蛋白质的数据库搜索鉴定
被引：6
作者：
盛泉虎
解涛
丁达夫
机构：
[1] 中国科学院上海生物化学研究所!上海
来源：
基金：
国家自然科学基金重大项目;
关键词：
蛋白质组信息学;
串联质谱;
数据库;
蛋白质鉴定;
D O I：
暂无
中图分类号：
Q987 [人类遗传学];
学科分类号：
071007 ;
摘要：
蛋白质的鉴定是蛋白质组学研究中必不可少的一步。用串联质谱 (tandemmassspectrometry ,MS/MS)可以进行多肽的从头测序 (denovosequencing) ,并搜索数据库以鉴定蛋白质。用图论以及真实谱 理论谱联配 (alignment)的方法对串联质谱得到的多肽图谱进行从头解析 ,得到了可靠的多肽序列 ,并应用到数据库搜索中鉴定了相应的蛋白质。同时 ,还用统计的方法对SwissProt以及TrEMBL蛋白质数据库进行了详细的分析。结果表明 ,3个四肽或者 2个五肽或者 1个八肽一般可以唯一地确定一个蛋白质
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