宁波地区新生儿轮状病毒VP7基因序列分析

被引：6

作者：

高红 ^{[1
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许国章 ^{[1
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董红军 ^{[1
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胡逢蛟 ^{[1
]}

刘健毅 ^{[1
]}

罗学辉 ^{[2
]}

机构：

[1] 宁波市疾病预防控制中心

[2] 浙江省余姚市疾病预防控制中心

来源：

中国预防医学杂志 | 2007年 / 04期

关键词：

新生儿腹泻; 轮状病毒; VP7基因; 序列分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

R722.1 [新生儿疾病];

学科分类号：

100202 [儿科学];

摘要：

目的研究宁波地区新生儿轮状病毒流行株VP7基因的分子生物学特点以及遗传变异规律。方法通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测新生儿病毒性腹泻便样中的轮状病毒核酸;选择特殊电泳带型样品通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增VP7全基因并测序;测序结果利用DNAstar和Blast软件进行比对。结果通过PAGE发现11份样品中有9份阳性样品,其中带型为4-2-3-2的有7份,带型为3-2-2-2和4-2-1-2的各1份。3种带型各选一株进行VP7基因的扩增并测序,测序结果经分析发现,06NB3和06NB9与G1型标准株Wa的核苷酸同源性为84.4%和91.5%,氨基酸同源性分别为87.4%和94.8%,06NB2与G3型标准株YO的核苷酸同源性为95.3%,氨基酸的同源性为96.6%。结论宁波地区在新生儿中有A组轮状病毒流行,其电泳带型以典型的4-2-3-2为主,也可见特殊带型。06NB3和06NB9的VP7基因片段属G1型,06NB2则属于G3型。06NB3与国内外近几年流行的G1型毒株基因序列有较大差异,06NB9和06NB2则差异较小。

引用

页码：411 / 415

页数：5

共 3 条

[1]

轮状病毒的病毒血症及肠道外损害 [J].