罗非鱼海豚链球菌16S rRNA基因的序列测定和系统进化分析

被引:39
作者
甘西 [1 ]
陈明 [1 ]
余晓丽 [1 ]
李莉萍 [1 ]
陈汉忠 [2 ]
徐增辉 [2 ]
雷爱莹 [1 ]
梁万文 [1 ]
黄维义 [2 ]
机构
[1] 广西水产研究所
[2] 广西大学动物科学技术学院
关键词
罗非鱼; 海豚链球菌; 16SrRNA; 克隆; 系统发育进化树;
D O I
暂无
中图分类号
S943 [各种鱼的病害、敌害及其防治];
学科分类号
0906 ;
摘要
为了从分子水平上对1株致病性罗非鱼链球菌进行分类学鉴定,利用原核生物16SrRNA基因通用引物对分离纯化的罗非鱼致病性链球菌进行16S rRNA基因的克隆及序列分析。结果扩增出长约1.5 kp目的片段,测序得到1条长度为1 447 bp核苷酸序列。核苷酸相似性分析表明,序列与NCB I公布的海豚链球菌(Streptococcus iniae,S.iniae)SCCF5L菌株16SrRNA基因核苷酸序列相似性最高(99.4%),暂称为中国广西株(S.iniae-CGX)。同时,亲源关系较近的S.iniae、S.difficilis和S.agalactiae代表菌株构建的系统发育进化树显示,所得菌株与S.iniae代表菌株组成同一进化分支,与S.agalactiae代表菌株组成的另一进化分支距离较近(95.5%),而与S.difficilis代表菌株组成的进化分支距离较远(92.3%)。上述研究证实,本试验从发病罗非鱼脑组织分离到的致病性链球菌为海豚链球菌。
引用
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