在PCR-DGGE研究土壤微生物多样性中应用GC发卡结构的效应

被引：44

作者：

罗海峰

齐鸿雁

薛凯

王晓谊

王川

张洪勋

机构：

[1] 中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室,中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室,中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室,中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室,中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室,中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室北京,北京,北京,北京,北京,北京

来源：

生态学报 | 2003年 / 10期

关键词：

PCR-DGGE; 微生物多样性; GC发卡结构;

D O I：

暂无

中图分类号：

S154.3 [土壤微生物学];

学科分类号：

071012 ; 0713 ;

摘要：

应用普通细胞裂解法提取 3株实验菌株 (Escherichia coli DH5α,Staphylococcus aureus SA- 1和 A-grobacterium tumerfaciens 1 31 2 9)的基因组 DNA和应用基于高盐和长时高热的细胞裂解法提取 7种不同土壤样品中的微生物的基因组 DNA,两组不同结构的引物 F3 57GC,R51 8(在正向引物的 5′端有 GC发卡结构 )和 F3 57,R51 8,分别对实验菌株和土壤样品中微生物的 1 6Sr RNA基因 V3区进行扩增 ,均得到了目的片段。比较了不同引物扩增的 1 6S r DNA片段在 DGGE中的不同电泳行为 ,结果表明 ,含 GC发卡结构的PCR扩增产物在 DGGE中能够得到很好的分离 ,而无 GC发卡结构的 PCR产物则不能在 DGGE中获得满意分离。引入 GC发卡结构 ,使得对不同微生物的定性和分类更深入细致

引用

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页数：6