十字花科植物SAMDC基因同源序列的克隆与进化分析

被引:9
作者
丁淑丽
卢钢
李建勇
任彦
曹家树
机构
[1] 浙江大学园艺系农业部园艺作物生长发育与生物技术重点实验室
基金
国家高技术研究发展计划(863计划);
关键词
十字花科植物; SAMDC基因; 克隆; 进化分析;
D O I
10.16288/j.yczz.2007.01.020
中图分类号
Q943.2 [植物基因工程];
学科分类号
071007 ; 090102 ;
摘要
腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是参与植物多胺合成的一个关键酶。根据GenBank中已报道的SAMDC基因编码序列保守区域设计特异引物,运用PCR技术分别从十字花科6属14个物种中新克隆分离了SAMDC基因的同源序列。比较分析结果表明:这些同源序列的相似性达87%以上,所推导的氨基酸序列相似性达90%以上,且两者种间差异分别为0.2%10.1%和0.3%6.6%,属间差异除“圆白”萝卜外分别是4.9%13.6%和3.1%10.3%;SAMDC基因的核苷酸及其可能编码的氨基酸序列差异属间较种间大,可用于属间的分类等级研究;且氨基酸序列间的差异比核苷酸序列间的差异小的多,因而根据核苷酸序列构建了NJ与ME分子系统树。进化树直观地表明在亲缘进化关系上芸薹属与萝卜属较近,其他依次为山芥属、蔊菜属、拟南芥属,与荠菜属最远。研究结果有助于从分子水平阐明十字花科植物间的亲缘进化关系,可为其种质资源利用提供理论依据。
引用
收藏
页码:109 / 117
页数:9
相关论文
共 9 条
[1]   十字花科植物CYP86MF基因同源序列的克隆与进化分析 [J].
王玲平 ;
曹家树 ;
叶纨芝 ;
向洵 ;
周生茂 .
遗传, 2005, (03) :395-402
[2]   一种基于NJ的高效构建系统进化树算法 [J].
谭严芳 ;
金人超 .
计算机工程与应用, 2004, (21) :84-85+97
[3]   芸薹类蔬菜基因组DNA遗传多样性的RAPD分析 [J].
陈云鹏 ;
曹家树 ;
缪颖 ;
叶纨芝 .
浙江大学学报(农业与生命科学版), 2000, (02) :16-21
[4]   分子进化研究中系统发生树的重建 [J].
常青 ;
周开亚 .
生物多样性, 1998, (01) :55-62
[5]   中国白菜各类群的分支分析和演化关系研究 [J].
曹家树 ;
曹寿椿 ;
缪颖 ;
卢刚 ;
浙江农业大学园艺系 .
园艺学报, 1997, (01) :36-43
[6]   白菜及其相邻类群基因组DNA的RAPD分析 [J].
曹家树,曹寿椿,易清明 .
园艺学报, 1995, (01) :47-52
[7]   大白菜起源的杂交验证初报 [J].
曹家树,曹寿椿 .
园艺学报, 1995, (01) :93-94
[8]   试论大白菜品种的起源、分布和演化 [J].
谭其猛 .
中国农业科学, 1979, (04) :68-75
[9]  
十字花科植物BcMF2和BcMF4同源基因的克隆、表达及其进化关系研究[D]. 张弢.浙江大学 2005