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肝癌病人血清中庚型肝炎病毒非结构基因(NS)5区cDNA的序列分析
被引:2
作者:
魏来
常锦红
陶其敏
机构:
[1] 北京医科大学人民医院肝病研究所,北京医科大学人民医院肝病研究所,北京医科大学人民医院肝病研究所,
来源:
关键词:
庚型肝炎病毒;
序列分析;
基因,病毒;
肝肿瘤/病毒学;
D O I:
暂无
中图分类号:
R735.7 [肝肿瘤];
学科分类号:
100214 ;
摘要:
通过逆转录-套式-聚合酶链反应,从2例肝癌患者血清中扩增出长994bp的庚型肝炎病毒(HGV)cDNA序列,聚合酶链反应(PCR)产物纯化后以双脱氧末端终止法从双向直接测定其序列。结果,所分离的2株HGV NS5区994bp核苷酸与国外已发表的3株HGV序列比较,同源性为87.21%~93.67%;2株间的同源性为93.92%。根据所测得的cDNA序列推导出其编码的313氨基酸序列,在氨基酸水平上本文报告的2株与国外发表的3株序列相比,同源性在94.25%~97.44%之间,2株之间为96.49%。在此区内发现有16个保守的脯氨酸残基及8个保守的半胱氨酸残基。结论:首次从肝癌患者血清中分离出2株HGV,其NS5区部分序列在核苷酸水平及氨基酸水平均较保守,与非肝癌患者血清中分离的HGV相比,变异不大。
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