基于EST-SSR的福建地区茶树资源遗传多样性和亲缘关系分析

被引：34

作者：

刘振

姚明哲

王新超

陈亮

机构：

[1] 中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心/国家茶树改良中心

来源：

中国农业科学 | 2009年 / 05期

基金：

浙江省自然科学基金;

关键词：

福建; 茶树; EST-SSR; 遗传多样性; 亲缘关系;

D O I：

暂无

中图分类号：

S571.1 [茶];

学科分类号：

0902 ; 090203 ;

摘要：

【目的】通过对福建地区茶树资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为今后茶树亲本选择或遗传改良等提供依据。【方法】利用中国农业科学院茶叶研究所茶树分子生物学实验室新开发的23对和他人3对共26对EST-SSR引物对福建省的42份茶树种质资源进行PCR扩增,在所得相似系数的基础上进行UPGMA聚类,并绘制亲缘关系树状聚类图。【结果】26对引物共检测到等位位点86个,每个引物为2～5个,平均3.31个;遗传多态性信息含量(PIC)在0.05～0.75,平均值为0.56。期望杂合度(He)大小在0.02～0.81,平均值为0.60;观测杂合度(Ho)在0.02～0.97,平均值为0.55;群体内的Shannon指数为1.16。按相似系数为0.40可将参试的42份种质资源分为两大类。【结论】研究发现福建地区茶树资源具有相对较高的遗传多样性,并明确了不同资源间的亲缘关系。

引用

页码：1720 / 1727

页数：8

共 18 条

[1] Generation and characterization of 24 novel EST derived microsatellites from tea plant (Camellia sinensis) and cross-species amplification in its closely related species and varieties [J].

Zhao, Li-Ping ;

Liu, Zhen ;

Chen, Liang ;

Yao, Ming-Zhe ;

Wang, Xin-Chao .

CONSERVATION GENETICS, 2008, 9 (05) :1327-1331

[2] 福建茶树遗传资源的多样性和品种创新 [J].

叶乃兴 ;

杨如兴 ;

郭吉春 ;

杨江帆 .

福建农业大学学报, 2004, (02) :174-177

[3] 云南特有茶树种质资源遗传多样性的RAPD研究 [J].

段红星 ;

邵宛芳 ;

王平盛 ;

许玫 ;

庞瑞华 ;

张亚萍 ;

崔文锐 .

云南农业大学学报, 2004, (03) :246-254

[4]

Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Nei M. Genetics . 1978

[5] EST-SSRs的开发及应用研究进展 [J].

王家麟 ;

孙佳莹 ;

于清岩 ;

李亮 ;

王艳丽 ;

宋金壑 ;

刘春燕 ;

胡国华 ;

陈庆山 .

生物信息学, 2007, (03) :140-142

[6]

Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphism. Botstein D,White R L,Skolnick M,et al. The American Journal of Human Genetics . 1980

[7] 利用RAPD进行茶组植物遗传多样性和分子系统学分析 [J].