变形杆菌基因分型方法的评价

被引:14
作者
贾宁
林茂虎
陈世平
索继江
邢玉斌
江朝光
机构
[1] 解放军总医院
[2] 解放军第医院
关键词
变形杆菌; 基因分型; PCR;
D O I
暂无
中图分类号
R378 [病原细菌];
学科分类号
摘要
目的 筛选出适用于变形杆菌的最佳分型方法。方法 用脉冲场凝胶电泳 (PFGE)、随机扩增多态 DNA(RAPD)、重复元件序列 PCR(Rep-PCR)和肠杆菌基因间重复共有序列 PCR(ERIC-PCR) 4种方法对 44株变形杆菌进行基因分型。结果  RAPD可分为 17型 ,分辨率系数为 0 .93 2 ;Rep -PCR可分为 15型 ,分辨率系数为0 .916;ERIC-PCR可分为 2 3型 ,分辨率系数为 0 .941;PFGE可分为 3 6型 ,分辨率系数为 0 .988。结论  PFGE、RAPD、Rep-PCR和 ERIC-PCR4种基因分型方法对变形杆菌进行分型 ,其分型力和分辨力均很好 (均 DI>0 .90 ) ,其中 PFGE分辨力最高 ,重复性好 ,但实验费用高 ,时间长 ,对大规模广泛应用有局限性 ;Rep-PCR和 ER-IC-PCR分辨率虽略底于 RAPD,但重复性好 ,结果稳定 ,可广泛应用于多种菌属 ,不需要重复设计引物 ,易于实现标准化。
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