诺如病毒RT-PCR检测及进化树分析

被引:9
作者
王作虪
韩悦
安淑一
郭军巧
机构
[1] 辽宁省疾病预防控制中心
关键词
诺如病毒; RT-PCR; 进化树分析;
D O I
暂无
中图分类号
R450 [];
学科分类号
摘要
目的:了解辽宁省儿童诺如病毒感染情况。方法:用RT-PCR的方法对131份粪便标本进行检测。扩增出的目标片段克隆于T载体上测定序列,用Mega3.1软件、邻位相连法构建进化树。结果:共有22份粪便标本诺如病毒RT-PCR检测阳性。通过核苷酸碱基序列比对发现这22株诺如病毒碱基序列与2006~2007年在匈牙利、荷兰和日本引起流行的参考株碱基序列高度同源,进化树分析表明它们共同构成GII.4的一组新变异群;与欧洲食源性病毒监测网络诺如病毒数据库比较,发现它们与欧洲GII.4新变异株2006b同源性最高。结论:辽宁地区检测到的22株诺如病毒均属于GII.4新变异株2006b。
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