用焦磷酸测序技术检测凡纳滨对虾组织蛋白酶基因单核苷酸多态性

被引:4
作者
曾地刚
陈晓汉
彭敏
李咏梅
杨春玲
马宁
蒋伟明
黎铭
机构
[1] 广西水产研究所
关键词
凡纳滨对虾; 焦磷酸测序; 组织蛋白酶基因; 单核苷酸多态性;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
0908 ;
摘要
焦磷酸测序是一种新型的DNA测序技术,近年来开始应用于单核苷酸多态性(SNPs)检测。组织蛋白酶基因(Cathepsin-L,CTSL)在对虾的蜕皮周期中起重要的作用。本研究利用焦磷酸测序技术,对96个凡纳滨对虾的CTSL基因序列(GenBank登录号:AY366355)的C681G SNP位点进行检测分型。结果发现C/C、C/G和G/G基因型,频率分别是0.81、0.16和0.03,频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。统计分析结果表明在该群体中C681G SNP和体重关系不显著(P>0.05)。研究结果显示焦磷酸测序技术是一种高效的SNP检测技术,可以在对虾的遗传研究中发挥重要作用。
引用
收藏
页码:684 / 689
页数:6
相关论文
共 26 条
[1]  
Further development of multiplex single nucleotide polymorphism typing method, the DigiTag2 assay. N Nishida,T Tanabe,M Takasu,A Suyama,K Tokunaga. Analytical Biochemistry . 2007
[2]   温度、盐度对凡纳滨对虾精荚再生和精子质量的影响 [J].
袁路 ;
蔡生力 .
水产学报, 2006, (01) :63-68
[3]   单核苷酸多态性检测方法的研究进展 [J].
汪维鹏 ;
倪坤仪 ;
周国华 .
遗传, 2006, (01) :117-126
[4]  
Development of a single nu-cleotide polymorphismgenotyping microarray platformfor the i-dentification of bovine milk protein genetic polymorphisms. Chessa S,Chiatti F,Ceriotti G,et al. JDairy Sci . 2007
[5]   基于性状-标记回归的QTL区间测验方法 [J].
吴为人 ;
李维明 .
遗传, 2001, (02) :143-146
[6]  
Pyrosequencing(R):a simple method for accurate genotyping. King CR,Scott-Horton T. Methods in Molecular Biology . 2006
[7]  
Methodological improvements of pyrosequencingtechnology. Gharizadeh B,Akhras M,Nourizad N,et al. Journal of Biotechnology . 2006
[8]  
Large-scal identification, mapping, and genotyping of single-nucleotide polymorphisms in the human genome. Wang D G, Fan J B, Siao C J, et al. Science . 1998
[9]  
Detection of allelic imbalance in gene expression using pyrosequencing. Wang H,Elbein SC. Methods in Molecular Biology . 2006
[10]  
Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques. Aljanabi S M, Martinez I. Nucleic Acids Research . 1997