2004年SARS-CoV毒株S基因分子进化特征

被引：10

作者：

黄平 ^{[1
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宋怀东 ^{[2
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邹丽容 ^{[1
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李晖 ^{[1
]}

俞守义 ^{[3
]}

机构：

[1] 广东省疾病预防控制中心

[2] 上海第二医科大学附属瑞金医院医学基因组学国家重点实验室

[3] 南方医科大学流行病学教研室

来源：

中国人兽共患病学报 | 2006年 / 10期

关键词：

严重急性呼吸综合征; SARS-冠状病毒; S基因; 进化;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

目的通过对2004年SARS-CoV毒株S基因序列的变异分析,揭示SARS-CoV毒株S基因进化与SARS流行的关系。方法对广东地区2004年2株SARS-CoV毒株S基因进行序列分析,其余15株毒株S基因序列从GenBank检索,采用DNAStar5.0软件,对检索的SARS-CoV的S基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合临床资料对变异毒株进行进化速度分析。结果17株毒株中,S基因7个氨基酸位点全部置换,35个氨基酸位点在不同毒株中置换;所有SARS-CoV均通过氨基酸227位点的置换,增加一个糖基化位点。同义进化中,S基因置换速度为1.46×10-6个核苷酸,进化线性回归方程为Y=1.46×10-6X+0.000736,同时通过Ka计算显示S基因进化明显存在选择性压力。2004年17株SARS-CoV毒株可以分为两条进化途径,其中广东地区的人类的GZ0401毒株与果子狸的PC4-115毒株核苷酸同源性达到99.97%,氨基酸同源性为100%。结论冠状病毒S基因的1个糖蛋白位点增加,可能导致人类SARS-CoV毒株出现并SARS流行;2004年果子狸冠状病毒与人类SARS-CoV毒株分子结构类似,可能存在交叉宿主。S基因同义进化速度较流感HA1基因慢4.2倍,但基因进化明显存在选择性压力。

引用

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页数：4

共 3 条

[1] SARS-CoV毒株E、M、N和S基因分子变异研究 [J].