Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities

被引：942

作者：

A. C. R. da Silva ^{[1
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J. A. Ferro ^{[2
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F. C. Reinach ^{[1
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C. S. Farah ^{[22
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L. R. Furlan ^{[1
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R. B. Quaggio ^{[3
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C. B. Monteiro-Vitorello ^{[1
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M. A. Van Sluys ^{[4
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N. F. Almeida ^{[5
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L. M. C. Alves ^{[20
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A. M. do Amaral ^{[6
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M. C. Bertolini ^{[2
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L. E. A. Camargo ^{[7
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G. Camarotte ^{[8
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F. Cannavan ^{[4
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J. Cardozo ^{[4
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F. Chambergo ^{[9
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L. P. Ciapina ^{[10
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R. M. B. Cicarelli ^{[1
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L. L. Coutinho ^{[2
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J. R. Cursino-Santos ^{[10
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H. El-Dorry ^{[4
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J. B. Faria ^{[11
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A. J. S. Ferreira ^{[1
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R. C. C. Ferreira ^{[12
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M. I. T. Ferro ^{[1
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E. F. Formighieri ^{[12
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M. C. Franco ^{[2
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C. C. Greggio ^{[9
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A. Gruber ^{[9
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A. M. Katsuyama ^{[2
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L. T. Kishi ^{[13
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R. P. Leite ^{[13
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E. G. M. Lemos ^{[2
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M. V. F. Lemos ^{[14
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E. C. Locali ^{[2
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M. A. Machado ^{[15
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A. M. B. N. Madeira ^{[7
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N. M. Martinez-Rossi ^{[7
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E. C. Martins ^{[13
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J. Meidanis ^{[11
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C. F. M. Menck ^{[10
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C. Y. Miyaki ^{[16
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D. H. Moon ^{[12
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L. M. Moreira ^{[17
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M. T. M. Novo ^{[21
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V. K. Okura ^{[9
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M. C. Oliveira ^{[1
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V. R. Oliveira ^{[8
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H. A. Pereira ^{[16
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机构：

[1] Universidade de São Paulo,Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Av. Prof. Lineu Prestes 748

[2] Departamento de Botânica,Departamento Microbiologia, Instituto de Ciências Av. Prof. Lineu Prestes 1374

[3] Instituto de Biociências,Departamento de Patologia, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia

[4] Rua do Matão 277,Departamento de Tecnologia

[5] Universidade de São Paulo,Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias

[6] Universidade de São Paulo,Departamento de Melhoramento e Nutrição Animal, Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia

[7] Universidade de São Paulo,Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz

[8] Departamento de Biologica,Departamento de Computação e Estatística

[9] Instituto de Biociências,Departamento de Bioquímica e Tecnologia Química, Instituto de Química

[10] Universidade de São Paulo,Departamento de Ciências Biológicas, Faculdade Ciências Farmacêuticas

[11] Universidade Estadual Paulista,Departamento de Genética

[12] Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n,Departamento de Bioquímica e Imunologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto

[13] Universidade Estadual Paulista,Instituto de Computação

[14] Universidade Estadual Paulista,Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética/Instituto de Computação

[15] Fazenda Lageado,Department of Plant Pathology

[16] Universidade de São Paulo,undefined

[17] Universidade Federal de Mato Grosso do Sul,undefined

[18] Centro de Citricultura Sylvio Moreira—IAC,undefined

[19] Universidade Estadual Paulista,undefined

[20] Centro de Energia Nuclear na Agricultura,undefined

[21] Universidade Estadual Paulista,undefined

[22] Universidade de São Paulo,undefined

[23] Universidade de São Paulo,undefined

[24] Instituto de Tecnologia do Paraná,undefined

[25] IAPAR,undefined

[26] Universidade Estadual de Campinas,undefined

[27] Universidade Estadual de Campinas,undefined

[28] Alellyx Applied Genomics,undefined

[29] Kansas State University,undefined

来源：

Nature | 2002年 / 417卷 / 6887期

关键词：

D O I：

10.1038/417459a

中图分类号：

学科分类号：

摘要：

The genus Xanthomonas is a diverse and economically important group of bacterial phytopathogens, belonging to the γ-subdivision of the Proteobacteria. Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac) causes citrus canker, which affects most commercial citrus cultivars, resulting in significant losses worldwide. Symptoms include canker lesions, leading to abscission of fruit and leaves and general tree decline1. Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) causes black rot, which affects crucifers such as Brassica and Arabidopsis. Symptoms include marginal leaf chlorosis and darkening of vascular tissue, accompanied by extensive wilting and necrosis2. Xanthomonas campestris pv. campestris is grown commercially to produce the exopolysaccharide xanthan gum, which is used as a viscosifying and stabilizing agent in many industries3. Here we report and compare the complete genome sequences of Xac and Xcc. Their distinct disease phenotypes and host ranges belie a high degree of similarity at the genomic level. More than 80% of genes are shared, and gene order is conserved along most of their respective chromosomes. We identified several groups of strain-specific genes, and on the basis of these groups we propose mechanisms that may explain the differing host specificities and pathogenic processes.

引用

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