粤北普通野生稻遗传多样性研究及核心种质初步构建

普通野生稻在我国地理分布广阔,是栽培稻的祖先,是我国最重要、最有价值的作物种质资源之一。粤北是广东普通野生稻重要分布地之一,乃至在我国稻种资源中有着独特的地位。本研究以174份5个居群的粤北普通野生稻为实验材料,研究其遗传多样性、籼粳分化并构建核心种质,为普通野生稻的保护、评价、栽培稻研究利用提供理论和实践依据。 1.对粤北普通野生稻174份材料的21个形态性状分析研究表明,粤北普通野生稻表型遗传多样性丰富,平均遗传多样性指数为1.178。48对SSR引物对粤北普通野生稻进行遗传多样性分析结果表明,48个位点均有多态性,共检测出491个等位变异,平均等位变异数(A)为10.2292;有效等位变异数(Ae)为5.1324;总居群遗传多样性(Ht)为0.7562,无论在种内还是居群水平上遗传多样性都十分丰富,且绝大部分遗传变异来自居群内,居群遗传分化系数Gst为0.0578,即仅有5.78%的遗传变异来自于居群间。不论是从形态还是SSR水平上,粤北普通野生稻几个居群都没有明显的遗传分化。 2.利用28对籼粳特异性SSR引物对粤北普通野生稻群体进行分析。28对引物均有多态性,除了能扩增出典型的籼粳特异基因,还能扩增出普通野生稻特有的基因。通过遗传一致度聚类分析表明粤北普通野生稻存在初步籼粳分化;2份(1.15%)材料偏籼,172份(98.85%)材料偏粳,群体以偏粳为主。 3.根据21个形态性状数据对粤北普通野生稻群体分别以10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%进行聚类压缩,利用等位基因保留比例、平均遗传多样性指数、表型方差比值、变异系数比值对9个不同取样规模下的核心样品进行了比较分析,确定50%为适宜的取样比例。对初选核心种质评价分析表明在50%取样比例下,形态性状的符合率较高,能较好地保留原种质资源遗传变异。