基于SSR分子标记的兴安杜鹃群体遗传结构研究

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作者
满莉
机构
[1] 东北师范大学
关键词
兴安杜鹃; SSR; 遗传多样性; 群体遗传结构;
D O I
暂无
年度学位
2016
学位类型
硕士
导师
摘要
物种的遗传多样性和遗传结构是在漫长的进化过程中形成的,可以揭示物种的遗传背景、进化潜力、利用价值,对保护和利用优良物种具有重要的意义。兴安杜鹃(Rhododendron dauricum L.)是广泛分布于我国东北地区的一种半常绿灌木。因其具有良好的药用价值,目前对它的研究多集中在化学成分和药理研究等方面。然而关于其遗传结构的研究报道却很少。本文采用7对SSR(Simple sequence repeats)分子标记对分布在我国大兴安岭、小兴安岭、长白山以及辽东半岛的21个兴安杜鹃自然居群共153个个体进行遗传多样性和遗传结构分析,进而从分子水平评估其遗传多样性水平和群体间的分化程度;了解各个居群的亲缘关系;讨论地理隔离、繁育系统等因素对遗传结构的影响。结果显示,7对微卫星位点共检测到104个等位基因,其中包含20个特有等位基因。多态信息含量PIC值处于0.2246-0.8879之间,平均多态位点百分率为85.71%,观测杂合度平均值为0.4507,表明兴安杜鹃在物种水平上遗传多样性较丰富;居群间的遗传分化系数Fst为0.2089,说明兴安杜鹃居群间在分子水平上出现了较高的遗传分化;AMOVA分析结果显示,遗传变异主要分布于群体内,占78.44%,群体间的基因流Nm较小,为0.6314。根据结果推测,高山阻隔、气候差异、虫媒授粉、较小的基因流等因素都有可能导致兴安杜鹃群体间遗传分化增大;Mantel检验表明遗传距离和地理距离存在显著的相关性﹙r=0.2635,p<0.0500﹚;STRUCTURE分析结果以及聚类分析得到的系统树,显示地理距离较近的群体首先聚为一支,进一步证实了地理隔离对于兴安杜鹃群体间遗传分化的影响;瓶颈效应分析显示,有40%的群体(BY、WL、KD、LJ、SJ、HS、JH、TP)经历了近期的遗传瓶颈事件。基于上述结果有助于初步了解兴安杜鹃群体的遗传结构和动态过程,同时对杜鹃属种质资源保护具有重要意义。
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[1]
四川主栽小麦品种遗传多样性研究.[A].郑有良;陈玉清;魏育明;周永红;刘登才;兰秀锦;颜泽洪;张志清;.小麦遗传育种国际学术讨论会.2001,
[2]
长白山牛皮杜鹃的遗传多样性与分子亲缘地理学研究 [D]. 
刘雁飞 .
吉林大学,
2013
[3]
青藏高原特有植物垫状点地梅的种群遗传结构.[D].曾丽艳.复旦大学.2010, 11
[4]
岳桦的亲缘地理与遗传结构研究 [D]. 
尹晓 .
东北师范大学,
2014
[5]
基于SSR标记的四川中国樱桃野生居群的遗传多样性和遗传结构分析 [D]. 
陈娇 .
四川农业大学,
2013
[6]
濒危植物白皮松遗传多样性及遗传结构研究 [D]. 
周惠娟 .
西北大学,
2013
[7]
牛皮杜鹃遗传多样性的研究 [D]. 
杨志勇 .
吉林大学,
2009
[8]
梵净山冷杉的保护遗传学研究 [D]. 
张广荣 .
广西师范大学,
2008
[9]
Microsatellite based analysis of the genetic structure and diversity of <Emphasis Type="Italic">Capsicum chinense</Emphasis> in the Neotropics.[J].Marissa Moses;Pathmanathan Umaharan;Selvadurai Dayanandan.Genetic Resources and Crop Evolution.2014, 4
[10]
PICcalc: An Online Program to Calculate Polymorphic Information Content for Molecular Genetic Studies.[J]..Biochemical Genetics.2012, 9