汉坦病毒基因分型及其核苷酸序列特征分析

目的研究黑龙江省、吉林省和内蒙古自治区野外优势鼠种黑线姬鼠和大林姬鼠中汉坦病毒的基因型,建立一种扩增全S片段的方法,用以明确基因亚型及其进化,阐明汉坦病毒的遗传特征,为该地理区域肾综合征出血热的预防控制提供科学依据;研究沈阳一起实验动物Wistar大鼠感染汉坦病毒的基因类型以及当地褐家鼠和肾综合征出血热病人中汉坦病毒的基因型别及其特征,建立扩增全M片段的方法,为分析汉坦病毒与宿主的关系提供有力证据。 方法捕获鼠类啮齿动物,鉴定鼠种,取鼠肺液氮中保存,用间接免疫荧光法检测鼠肺中汉坦病毒抗原及汉坦病毒IgM和IgG抗体,提取阳性鼠肺中病毒RNA,采用RT-PCR的方法扩增汉坦病毒S,M片段序列,对序列进行系统发生学分析,同时采用Vero-E6细胞分离病毒。 结果黑龙江、吉林和内蒙古自治区三地黑线姬鼠和大林姬鼠共扩增出11份阳性标本,用全S片段构建系统发生树表明其携带汉坦病毒汉滩型的两个亚型,HTNV6和HTNV7。建立从鼠肺直接扩增全S片段的RT-PCR方法。从黑线姬鼠中分离到一株汉坦病毒HAa174。 沈阳三个单位实验用大白鼠(Wistar鼠)共计57只,其中抗原阳性标本26份,流行性出血热病人血清27份,褐家鼠阳性标本15份,通过部分S,M片段以及全S,M序列构建系统发生树分析表明沈阳市主要是家鼠型疫区,病毒主要存在汉城型S1和S3这两个亚型。建立从鼠肺直接扩增全M片段的方法。从实验用大白鼠(Wistar鼠)分离到一株汉坦病毒Wistar41。 结论东北地区黑线姬鼠和大林姬鼠主要携带汉滩型病毒,存在两个亚型HTNV6、7。沈阳市主要为家鼠型肾综合征出血热疫区,汉城病毒有两个亚型S1、S3。