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利用RAPD、ISSR标记分析鄂西地区柚种质资源遗传多样性
被引:0
作者
:
论文数:
引用数:
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机构:
石开明
机构
:
[1]
华中农业大学
关键词
:
柚;
种质资源;
RAPD;
ISSR;
遗传多样性;
D O I
:
暂无
年度学位
:
2004
学位类型
:
硕士
导师
:
蔡礼鸿;
彭振坤;
摘要
:
我国是柑桔的起源中心和遗传变异中心之一,柚的品种资源十分丰富。本研究以分布在鄂西的柚种质资源为对象,利用RAPD和ISSR分子标记对其进行研究,分析鄂西柚品种(类型)的遗传多样性。结果如下: 1.对照常规RAPD和ISSR工作分析程序,在对鄂西柚种质资源分析时作了部分调整,如DNA提取,PCR反应体系等细节。建立了一套适合于分析柚种质资源的RAPD和ISSR反应体系。本研究中建立的适合于柚种质资源分析的RAPD最佳反应体系为:DNA(20ng/μL),引物(1μmol/e),MgCh(1.5mM),TaqDNA聚合酶1.5U,dNTPs(200μmol/L),PCR循环程序:94℃4min,一次循环;94℃1min,35℃1min,72℃2min,40次循环;72℃7min,一次循环。ISSR最佳反应体系为:DNA(20ng/μL),引物(1μmol/L),MgCl2(2.0mM),TaqDNA聚合酶1.5U,dNTPs(200μmol/L);PCR循环程序:94℃4min,一次循环;94℃40s,48℃~56℃60s,72℃2min,30次循环;72℃7min,一次循环。 2.从120条RAPD随机引物中筛选出22条在样品间具多态性的引物,对鄂西柚种资源65份材料进行RAPD分析,扩增共产生207条RAPD标记带,其中多态性带104条,多态性百分率为50.2%;从50条ISSR引物中共筛选出13条在所有样品中均能产生清晰扩增带的ISSR引物,扩增共产生136条ISSR标记带,其中多态性带82条,多态性百分率为60.3%。检测效果表明,ISSR效果明显优于RAPD。 2.根据RAPD和ISSR结果聚类分析,表明鄂西柚种资源单株间遗传差异明显。根据DNA标记数据转化遗传距离矩阵所作UPGMA树系图表明,RAPD聚类结果和ISSR聚类结果均可将所有材料划分为3大类群,3大类群内聚集的柚类型间遗传差异比较大,分化明显。该地区内沙田柚存在较大差异,长寿沙田柚的几个类型和来自广东、广西的沙田柚类型聚类明显比较分散,其地区性差异显著。同时,研究表明鄂西本地区的一些沙田柚类型也产生了一定程度的遗传差异。 研究表明,RAPD和ISSR标记技术都能较好地反应各柚类型的遗传差异,适于进行遗传距离相对较近的柚种内各类型间的品系鉴定和遗传关系分析。同时文中还就RAPD和ISSR技术方法问题进行了讨论,并对鄂西柚种质资源保护提出了一些建议。
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共 50 条
[1]
利用分子标记对桃、李、杏、梅、樱类植物系统发育的分析
[J].
论文数:
引用数:
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机构:
程中平
.
中国南方果树,
2003,
(03)
:45
-50
[2]
苹果品种ISSR指纹图谱构建
[J].
宣继萍
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机构:
南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京
宣继萍
;
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章镇
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机构:
房经贵
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机构:
高志红
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车胜利
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机构:
南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京
车胜利
.
果树学报,
2002,
(06)
:421
-423
[3]
柚类品种遗传相互关系的RAPD标记研究
[J].
论文数:
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机构:
张太平
;
彭少麟
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中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
彭少麟
;
王峥峰
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机构:
中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
王峥峰
;
凌定厚
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中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
凌定厚
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甘廉生
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机构:
中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
甘廉生
.
热带亚热带植物学报,
2001,
(04)
:322
-328
[4]
几种木本果树DNA的有效提取
[J].
程运江
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
程运江
;
伊华林
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
伊华林
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庞晓明
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
庞晓明
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郭文武
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
郭文武
;
邓秀新
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
邓秀新
.
华中农业大学学报,
2001,
(05)
:481
-483
[5]
柑桔RAPD技术体系建立与体细胞杂种鉴定
[J].
论文数:
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机构:
史永忠
;
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机构:
郭文武
;
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机构:
邓秀新
.
园艺学报,
1998,
(02)
[6]
桃早熟芽变品种‘大观一号’的RAPD分析及其特异片段的克隆
[J].
金勇丰
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浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学生化所,浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学园艺系!杭州,
金勇丰
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张耀洲
;
陈大明
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浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学生化所,浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学园艺系!杭州,
陈大明
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张上隆
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浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学生化所,浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学园艺系!杭州,
张上隆
.
果树科学,
1998,
(02)
:103
-106
[7]
一种木本果树基因组DNA提取方法研究
[J].
陈大明
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浙江农业大学园艺系
陈大明
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张上隆
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金勇丰
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金勇丰
.
浙江农业大学学报,
1997,
(06)
[8]
RAPD技术——检测平邑甜茶遗传一致性的有效方法(简报)
[J].
张开春
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沈阳农业大学园艺系,北京市农林科学院林业果树研究所
张开春
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吴禄平
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吴禄平
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李荣旗
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沈阳农业大学园艺系,北京市农林科学院林业果树研究所
李荣旗
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毕晓颖
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景士西
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尹淑萍
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沈阳农业大学园艺系,北京市农林科学院林业果树研究所
尹淑萍
.
农业生物技术学报,
1997,
(02)
[9]
柚类生产在我国柑桔业持续发展中的作用
[J].
何天富
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中国农业科学院柑桔研究所
何天富
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何绍兰
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邓烈
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中国农业科学院柑桔研究所
邓烈
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谢治银
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中国农业科学院柑桔研究所
谢治银
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中国南方果树,
1997,
(02)
[10]
柚Citrus grandis(L.) Osbeck种质多样化中心的探讨
[J].
叶荫民
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中国农业科学院柑桔研究所
叶荫民
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中国南方果树,
1997,
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[1]
利用分子标记对桃、李、杏、梅、樱类植物系统发育的分析
[J].
论文数:
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机构:
程中平
.
中国南方果树,
2003,
(03)
:45
-50
[2]
苹果品种ISSR指纹图谱构建
[J].
宣继萍
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机构:
南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京
宣继萍
;
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机构:
章镇
;
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房经贵
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高志红
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车胜利
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南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院,南京农业大学园艺学院江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京
车胜利
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果树学报,
2002,
(06)
:421
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[3]
柚类品种遗传相互关系的RAPD标记研究
[J].
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机构:
张太平
;
彭少麟
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中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
彭少麟
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王峥峰
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中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
王峥峰
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凌定厚
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中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
凌定厚
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甘廉生
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中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,中国科学院华南植物研究所,广东省农业科学院果树研究所广东广州现工作地址:华南理工大学环境科学与工程系,广州,广东广州,广东广州,广东广州,广东广州
甘廉生
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热带亚热带植物学报,
2001,
(04)
:322
-328
[4]
几种木本果树DNA的有效提取
[J].
程运江
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
程运江
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伊华林
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庞晓明
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郭文武
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邓秀新
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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
邓秀新
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华中农业大学学报,
2001,
(05)
:481
-483
[5]
柑桔RAPD技术体系建立与体细胞杂种鉴定
[J].
论文数:
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机构:
史永忠
;
论文数:
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机构:
郭文武
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机构:
邓秀新
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园艺学报,
1998,
(02)
[6]
桃早熟芽变品种‘大观一号’的RAPD分析及其特异片段的克隆
[J].
金勇丰
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机构:
浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学生化所,浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学园艺系!杭州,
金勇丰
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张耀洲
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陈大明
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张上隆
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浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学生化所,浙江农业大学园艺系!杭州,,浙江农业大学园艺系!杭州,
张上隆
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果树科学,
1998,
(02)
:103
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[7]
一种木本果树基因组DNA提取方法研究
[J].
陈大明
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金勇丰
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浙江农业大学学报,
1997,
(06)
[8]
RAPD技术——检测平邑甜茶遗传一致性的有效方法(简报)
[J].
张开春
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沈阳农业大学园艺系,北京市农林科学院林业果树研究所
张开春
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吴禄平
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李荣旗
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景士西
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尹淑萍
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机构:
沈阳农业大学园艺系,北京市农林科学院林业果树研究所
尹淑萍
.
农业生物技术学报,
1997,
(02)
[9]
柚类生产在我国柑桔业持续发展中的作用
[J].
何天富
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中国农业科学院柑桔研究所
何天富
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何绍兰
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邓烈
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谢治银
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中国南方果树,
1997,
(02)
[10]
柚Citrus grandis(L.) Osbeck种质多样化中心的探讨
[J].
叶荫民
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中国农业科学院柑桔研究所
叶荫民
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中国南方果树,
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