近年来,心血管疾病以其惊人的发病率和致死率被称为“世界头号杀手”。该疾病相关的作用机制十分复杂,并且至今仍不清楚。中医药始终以从综合和整体的角度对抗复杂疾病为目的,并且在心血管疾病的治疗方面已经表现出良好的效果。然而,从系统层面上了解中药对于心血管疾病的多尺度治疗策略仍然是一个难题。因此,本研究以维药名方——-复方西红花治疗心血管疾病为例,运用系统药理学方法揭示中药治疗复杂疾病的潜在分子机制。首先,通过ADME筛选和药物靶点预测,我们获取了103个活性化合物以及对应的219个直接靶标,并且通过实验验证了某些关键的化合物靶点相互作用关系。基于以上工作,我们随之构建了活性化合物,靶点和疾病之间的相互关系,以此揭示维药复方西红花在治疗心血管疾病方面的药理作用。最后,我们将与心血管疾病相关的不同调控模块整合成一个“心血管疾病治疗通路”,以此揭示维药复方西红花在不同心血管疾病病理过程相关的生物过程层面对疾病的治疗效果。以上研究证明了维药复方西红花通过调控心血管疾病相关生物过程发挥其多尺度治疗活性,这也为现代医学治疗复杂疾病提供了一种新的潜在方法。