中国重庆非糖尿病性重度冠心病血清线粒体DNA T16189C巢式PCR-RFLP多态性分析

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作者
吴永昌
机构
[1] 重庆医科大学
关键词
冠心病; 线粒体DNA; T16189C; 多态性; PCR-RFLP;
D O I
暂无
年度学位
2012
学位类型
硕士
导师
摘要
目的 建立巢式-多聚酶链反应-限制性片段长度多态性分析(nested-polymerase chain reaction-restriction fragment lengthpolymorphism, nested-PCR-RFLP)方法检测血清线粒体DNA T16189C(mitochondrial DNA T16189C, mtDNA T16189C)变异,分析T16189C多态性与重庆地区非糖尿病性(non-diabetes mellitus,non-DM)重度冠心病(coronary heart disease, CHD)的相关性。 方法 1.建立血清DNA的提取方法,设计针对mtDNA T16189C变异位点的外套引物和内套引物,分别以内套引物行常规PCR,以内、外套引物行nested-PCR扩增目的基因,电泳确认血清mtDNA提取成功,并比较两种方法对血清mtDNA检测的敏感性。nested-PCR产物经RFLP和测序鉴定确认mtDNA T16189C变异位点,并对nested-PCR-RFLP进行方法学评价。 2.收集中国重庆地区82例非糖尿病性重度CHD患者血清及对应临床资料,50例非糖尿病、非冠心病受试者血清作为对照。提取血清DNA,联合应用常规PCR及nested-PCR评估不同组别血清mtDNA含量的高低。利用建立的nested-PCR-RFLP方法检测mtDNAT16189C变异位点,分别比较mtDNA含量、mtDNA T16189C变异与该类人群的相关性,并进一步分析非糖尿病性重度CHD不同mtDNA含量组间mtDNAT16189C变异情况。 结果 1.血清mtDNA的提取和nested-PCR-RFLP方法的建立及评价:(1)成功建立了血清mtDNA提取和血清mtDNA的nested-PCR-RFLP方法,通过实验优化得到PCR和酶切反应的最佳条件,经RFLP和测序鉴定与预期结果一致。(2)nested-PCR电泳检测Qiagen试剂盒所提200μl人类血清的mtDNA的敏感性为100%,nested-PCR-RFLP检测血清mtDNAT16189C多态性简单快速、特异性和敏感性均高。 2.血清mtDNA浓度及mtDNA T16189C变异与非糖尿病性重度CHD危险因素的相关性分析:(1)血清mtDNA含量在非糖尿病性重度CHD患病组显著低于健康对照组(χ2=9.979, P<0.05,OR=0.318,95%CI:0.153~0.660);在患病组中,女性高于男性,并随年龄增加而增加,高LDL-c组低于正常组、吸烟低于非吸烟组(P<0.05);在血压、HDL-c、TC、血糖调节各组内差异无统计学意义(P>0.05)。多因素非条件logistic回归分析结果显示:吸烟(OR=3.70;95%CI:1.285~10.870)是导致血清mtDNA浓度减低的主要影响因素。(2)mtDNA T16189C变异率在非糖尿病性重度CHD组(32.93%)高于健康对照组(22%),但差异无统计学意义(P>0.05);在重度CHD病人中,合并血糖调节受损(impired glucose tolerance,IGT)者明显高于血糖正常者和健康对照(P<0.05),但血糖正常重度CHD组和健康对照组差异无统计学意义(P>0.05);在重度CHD病人中,合并高血压者高于血压正常重度CHD组和健康对照组(P<0.05),但血压正常重度CHD组和健康对照组间差异无统计学意义(P>0.05)。重度CHD组内及其与对照组之间,mtDNAT16189C变异率与性别、年龄、吸烟、LDL-c、HDL-c、TC等因素均无关,差异无统计学意义(P>0.05)。非条件logistic回归分析结果显示:高血压(OR=3.265;95%CI:1.061~10.06)是导致血清mtDNA T16189C变异的主要影响因素。(3)非糖尿病性重度CHD患者血清mtDNA T16189C变异率在mtDNA高浓度组显著高于低浓度组(χ2=5.612, P<0.05;OR=3.154,95%CI:0.197~8.307)。 结论 成功建立了血清mtDNA T16189C的提取及nested-PCR-RFLP方法,可作为循环mtDNA基因多态性和相关性流行病学研究的重要工具之一。 非糖尿病性重度CHD患者血清mtDNA含量显著低于健康对照,且女性组高于男性组、高龄组高于低龄组、高LDL组低于正常组、吸烟低于非吸烟组;并且吸烟是导致血清mtDNA浓度减低的主要影响因素。mtDNA T16189C变异率与血糖调节受损(IGT)和高血压有关,高血压是导致血清mtDNA T16189C变异的主要影响因素,并与血清mtDNA浓度高低有关。
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