茄子品种遗传多样性的RAPD检测与聚类分析

被引:17
作者
王秋锦 [1 ]
高杰 [2 ]
孙清鹏 [1 ]
杨爱珍 [1 ]
赵福宽 [1 ]
机构
[1] 北京农学院生物技术系
[2] 新疆农业大学园艺学院
基金
北京市自然科学基金;
关键词
RAPD; 茄子; 遗传多样性; 聚类分析;
D O I
暂无
中图分类号
S641.1 [茄子];
学科分类号
090202 ;
摘要
用RAPD分子标记的方法对来自不同国家的34份茄子品种进行遗传多样性分析,从120条RAPD引物中筛选出有效的22条引物分别对34份茄子品种进行扩增,共检测出232个等位基因位点,每条引物平均检测出10.5个,其中192个为多态位点,多态位点比率为82.76%。POPGENE结果分析表明,Nei's基因多样性H为0.2756,Shannon指数为0.4145,显示出丰富的遗传多样性。计算得出的Jaccard相似系数变化范围为0.331~0.805,根据Jaccard相似系数和组内连接法建立的系统聚类图,34份茄子大致可分为两大类型:圆茄类型和长茄类型,这与经典的形态学分类基本上相符,从而从分子水平上支持了以果形作为茄子品种分类指标的观点。
引用
收藏
页码:1035 / 1039
页数:5
相关论文
共 10 条
[1]  
中国蔬菜品种志.[M].中国农业科学院蔬菜花卉研究所主编;.中国农业科技出版社.2002,
[2]   RAPD genetic homogeneity and high levels of bacterial wilt tolerance in Solanum torvum Sw. (Solanaceae) accessions from Reunion Island [J].
Clain, C ;
Da Silva, D ;
Fock, I ;
Vaniet, S ;
Carmeille, A ;
Gousset, C ;
Sihachakr, D ;
Luisetti, J ;
Kodja, H ;
Besse, P .
PLANT SCIENCE, 2004, 166 (06) :1533-1540
[3]   Analysis of eggplant (Solanum melongena)-related germplasm:: morphological and AFLP data contribute to phylogenetic interpretations and germplasm utilization [J].
Furini, A ;
Wunder, J .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2004, 108 (02) :197-208
[4]   RFLP analysis of a PCR amplified region of chloroplast DNA in eggplant and related Solanum species [J].
Isshiki, S ;
Uchiyama, T ;
Tashiro, Y ;
Miyazaki, S .
EUPHYTICA, 1998, 102 (03) :295-299
[5]  
Allozyme variation in the eggplant; Solanum melongena L. (Solanaceae).[J].J. L. Karihaloo;L. D. Gottlieb.Theoretical and Applied Genetics.1995, 3
[6]   RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA VARIATION IN THE EGGPLANT, SOLANUM-MELONGENA L (SOLANACEAE) [J].
KARIHALOO, JL ;
BRAUNER, S ;
GOTTLIEB, LD .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 1995, 90 (06) :767-770
[7]   我国南方长茄种质资源的ISSR标记分析 [J].
毛伟海 ;
杜黎明 ;
包崇来 ;
胡天华 ;
朱琴妹 ;
胡海娇 .
园艺学报, 2006, (05) :1109-1112
[8]   利用RAPD分析部分茄子品种的亲缘关系 [J].
封林林 ;
屈冬玉 ;
连勇 ;
金黎平 ;
王晓武 ;
宋燕 .
中国蔬菜, 2002, (04) :37-38
[9]   亚洲部分茄子品种资源数量分类 [J].
易金鑫 .
园艺学报, 2000, (05) :345-350
[10]   关于植物随机引物扩增多态性DNA标记的可靠性问题 [J].
刘春林 ;
官春云 ;
李栒 .
植物生理学通讯, 2000, (01) :56-59