从中国 14个城市戊型肝炎病人血清中检测到的戊型肝炎病毒部分核苷酸序列分析(英文)

被引:10
作者
李奎
庄辉
朱万孚
机构
[1] 北京大学医学部微生物学系
[2] 北京大学医学部微生物学系 北京
[3] 北京
关键词
戊型肝炎病毒; 聚合酶链反应法; 直接测序法; 基因进化树分析;
D O I
暂无
中图分类号
R373 [人体病毒学(致病病毒)];
学科分类号
100103 ; 100705 ;
摘要
目的 调查从中国病人血清中分离的戊型肝炎病毒 (HEV)基因型。方法 应用聚合酶链反应法 (PCR)和直接测序法对从中国 14个城市检测到的 4 5株HEV开放读码框架 2 (ORF2 )的部分基因序列 (nt6 46 1 6 86 0及nt5 994 6 2 94 )进行分析。结果  4 5株HEV中 ,4 1株 (91% )与缅甸株属同一个基因型 ,与中国代表株HEV核苷酸序列的同源性均在 98%以上。仅 4株与 3个HEV原型株差异较大 ,与缅甸株 /中国株同源性为 77% - 80 % ,与墨西哥株的同源性为 74 %- 76 % ,与新发现的美国株 /猪 (US/Swine)HEV的同源性为 74 % - 77% ;基因进化树分析表明 ,该 4株HEV可能为一新基因型的 2个不同亚型 ,它们与原型墨西哥株、缅甸株和美国株 /猪HEV明显不同。结论 中国戊型肝炎患者中 ,多数感染中国原型株HEV ,仅少数感染新基因型HEV。
引用
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共 2 条
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