抑制消减杂交结合cDNA微阵列技术鉴定人肾癌组织高表达基因谱

被引:8
作者
艾军魁
张志文
辛殿祺
朱宏建
严泉剑
辛钟成
那彦群
郭应禄
机构
[1] 北京大学泌尿外科研究所,北京大学医学部生理学系,北京大学泌尿外科研究所,北京大学泌尿外科研究所,第四军医大学西京医院泌尿外科,北京大学泌尿外科研究所,北京大学泌尿外科研究所,北京大学泌尿外科研究所北京大学第一医院泌尿外科,北京,北京,北京大学第一医院泌尿外科,北京,北京大学第一医院泌尿外科,北京,西安,北京大学第一医院泌尿外科,北京,北京大学第一医院泌尿外科,北京,北京大学第一医院泌尿外科,北京
关键词
抑制消减杂交; 基因芯片; 肾癌; 基因; 差异表达;
D O I
暂无
中图分类号
R737.11 [肾、肾盂肿瘤];
学科分类号
100214 ;
摘要
为克隆肾癌组织高表达基因,探讨肾癌发生、发展的分子基础,以人肾癌组织mRNA为试验方,正常肾组织mRNA为对照构建抑制消减杂交文库。用文库379个克隆制作基因芯片,以同位素标记探针对文库进行高通量筛选,对肾癌组织中表达增高6倍以上的67个克隆进行测序,结果在GenBank中进行比对分析,其中4个克隆为新EST片段,2个为KIAA类基因,其余克隆为已知基因。其中已有文献报道的肾癌相关基因,如VEGF,波形蛋白,组织因子等,大部分为新发现的肾癌相关基因,包括锌带蛋白、垂体瘤转化基因1等。3个EST及一些在肾癌组织中高表达的已知基因以Northern杂交、RT-PCR作了验证。免疫组化与Western blot进一步证实锌带蛋白与垂体瘤转化基因1在肾癌组织中表达显著增强。这些高表达的基因可能成为肾癌诊断、治疗的潜在靶点,有助于从基因谱的角度进一步认识肾癌发生、发展的分子机制。
引用
收藏
页码:436 / 445
页数:10
相关论文
共 11 条
[1]   肾癌抑制性消减杂交文库的构建及意义 [J].
艾军魁 ;
陈琳 ;
黄啸 ;
张勇 ;
张强 ;
果宏峰 ;
梁丽莉 ;
那彦群 ;
张志文 ;
郭应禄 .
中华泌尿外科杂志, 2002, (09) :4-7
[2]  
现代分子生物学实验技术[M]. 中国协和医科大学出版社 , 卢圣栋主编, 1999
[3]   Differentially expressed gene profiles between multidrug resistant gastric adenocarcinoma cells and their parental cells [J].
Zhao, YQ ;
You, H ;
Liu, F ;
An, HZ ;
Shi, YQ ;
Yu, Q ;
Fan, DM .
CANCER LETTERS, 2002, 185 (02) :211-218
[4]   The changing natural history of renal cell carcinoma [J].
Pantuck, AJ ;
Zisman, A ;
Belldegrun, AS .
JOURNAL OF UROLOGY, 2001, 166 (05) :1611-1623
[5]   Radioactive 33-P probes in hybridization to glass cDNA microarrays using neural tissues [J].
Whitney, LW ;
Becker, KG .
JOURNAL OF NEUROSCIENCE METHODS, 2001, 106 (01) :9-13
[6]   A new zinc ribbon gene (ZNRD1) is cloned from the human MHC class I region [J].
Fan, WF ;
Wang, ZH ;
Kyzysztof, F ;
Prange, C ;
Lennon, G .
GENOMICS, 2000, 63 (01) :139-141
[7]  
Urinary tissue factor: a potential marker of disease[J] . Bashir A.Lwaleed,Paul S.Bass,John L.Francis.J. Pathol. . 1999 (1)
[8]  
A profile of differentially expressed genes in primary colorectal cancer using suppression subtractive hybridization[J] . FEBS Letters . 1999 (1)
[9]  
Molecular cloning, genomic organization, and identification of the promoter for the human pituitary tumor transforming gene (PTTG)[J] . Sham S. Kakar.Gene . 1999 (2)
[10]   Present achievements in the medical treatment of metastatic renal cell carcinoma [J].
Ravaud, A ;
Debled, M .
CRITICAL REVIEWS IN ONCOLOGY HEMATOLOGY, 1999, 31 (01) :77-87