应用HMM和加权距离判别法的真核基因识别程序研究

被引:4
作者
史良
尉春艳
高琦
机构
[1] 西安交通大学
关键词
隐马尔可夫模型; 基因识别; 加权距离判别法;
D O I
暂无
中图分类号
Q78 [基因工程(遗传工程)];
学科分类号
071007 ; 0836 ; 090102 ;
摘要
根据现代科学对基因的认识 ,应用了隐马尔科夫模型 (HMM)的算法 ,以大量核酸序列为信息来源 ,通过计算机计算来寻找未知基因的大体位置 ;再通过基因的固有结构特征及密码子使用的偏向性 ,使用加权距离判别法来准确地定位基因 ,以图形及文本的形式输出 ,从而极大地方便了实验室的研究工作。考虑到基因的许多特征还不为人们所了解 ,而且不同物种之间基因结构又有一定的差异 ,所以还开发了程序自学习功能 ,不断地存储已知的基因 ,再据此改变一些已有固有数据 ,以便更好地适应和了解不同生物基因结构的特异性 ,更加准确地寻找未知基因的位置。
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