SCoT结合克隆测序鉴别湖南甜橙变异类型

被引：39

作者：

蒋巧巧 ^{[1
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龙桂友 ^{[1
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李武文 ^{[4
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邓子牛 ^{[1
,2
,3
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机构：

[1] 湖南农业大学园艺园林学院

[2] 国家柑橘改良中心长沙分中心

[3] 湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室

[4] 湖南永兴县农业局

来源：

中国农学通报 | 2011年 / 06期

关键词：

甜橙; SCoT; 均匀设计; 序列比对;

D O I：

暂无

中图分类号：

S666.4 [橙];

学科分类号：

090201 [果树学];

摘要：

本试验对SCoT反应体系进行优化,并筛选合适的引物,然后对24份试材进行SCoT标记,获得的目的片段克隆测序,通过测序结果探讨其遗传变异;结果表明,甜橙SCoT标记的20μL优化反应体系为:DNA模板80ng,Mg2+浓度1.6mmol/L,dNTPs浓度0.3mmol/L,引物浓度0.2μmol/L,Taq DNA聚合酶用量1.6U,扩增产物在100～2000bp之间,扩增条带明亮清晰,反应体系具有良好的稳定性和可重复性。24份试材的测序片段的大小为1090～1091bp,一致性达到99.84%,存在单碱基的缺失与替换,BLAST结果显示,该序列的编码蛋白质与核糖体蛋白S3的N端同源性高;利用单碱基变异可以区分其中的12个甜橙变异株系和'安江香柚',其他变异株系还需要结合其他的分子标记技术来进行鉴别,有待进一步研究。

引用

页码：148 / 154

页数：7

共 15 条

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