基于SNP标记的黄瓜杂交种纯度鉴定方法

被引:28
作者
兰青阔 [1 ]
张桂华 [2 ]
王永 [1 ]
赵新 [1 ]
朱珠 [1 ]
崔兴华 [2 ]
郭永泽 [1 ]
程奕 [1 ]
机构
[1] 天津市农业科学院中心实验室
[2] 天津科润农业科技股份有限公司黄瓜研究所
基金
天津市科技支撑计划;
关键词
黄瓜; 种子纯度; 高分辨率溶解曲线; SNP标记; 焦磷酸测序;
D O I
10.19928/j.cnki.1000-6346.2012.06.010
中图分类号
S642.2 [黄瓜];
学科分类号
摘要
根据国际葫芦科基因组数据库CuGenDB中序列信息,应用高分辨率熔解曲线技术筛选出用于黄瓜杂交种纯度鉴定的SNP位点CLA6(A/G),该位点在33个市售黄瓜品种中的多态信息量为0.401,处于中度多态;结合焦磷酸测序技术,建立基于CLA6位点的SNP-Pyrosequencing黄瓜杂交种纯度鉴定方法。利用该鉴定方法检测黄瓜杂交种优一90粒种子,结果其种子纯度为96.7%,该结果与CLA0位点及SSR鉴定结果相符,表明该鉴定技术适于黄瓜杂交种纯度鉴定,具有用于DUS测试分析的潜力。
引用
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