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浙江省乙型流感病毒HA1基因分析
被引:12
作者:
李敏红
周敏
茅海燕
卢亦愚
严菊英
龚黎明
葛琼
机构:
[1] 浙江省疾病预防控制中心
来源:
关键词:
乙型流感病毒;
血凝素基因;
核苷酸序列;
Yamagata系;
Victoria系;
D O I:
暂无
中图分类号:
R373.13 [];
学科分类号:
100103 ;
100705 ;
摘要:
目的:了解浙江省近几年乙型流感病毒的基因变异情况和WHO推荐流感疫苗株对浙江省人体的保护情况。方法:采集浙江省类流感样本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,用DNAMAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐疫苗株基因进行比对。结果:分离到Yamagata系和Victoria系两个进化系的乙型流感病毒,两系毒株均未发现核苷酸的丢失和插入,糖基化位点没有太大改变。毒株之间核苷酸的同源性为95.25%,氨基酸的同源性为95.28%。Yamagata系毒株HA1区域核苷酸序列长度为1038 bp,推导的氨基酸序列长度为346个,氨基酸变异替换数在6~8之间;Victoria系毒株HA1区域的核苷酸序列长度为1041 bp,推导的氨基酸序列长度为347个,氨基酸变异替换数在2~8之间,相比Yamagata系毒株在163位上都多1个天冬酰胺(N)。基因进化树上可见明显的Yamagata系和Victoria系两个分支。结论:浙江省人群交替流行着Yamagata系和Victoria系两个抗原性不同的进化系的乙型流感病毒,病毒的基因发生了变异,抗原已发生漂移。2001、2006两年WHO推荐乙型流感疫苗株与我省当年流行株为不同谱系毒株,预防保护效果不够理想,其余年份为同一谱系毒株,预防保护效果较好。
引用
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