南海西沙海槽表层沉积物微生物多样性

利用非培养的分子技术研究了西沙海槽表层沉积物中的微生物群落。沉积物中扩增的古菌16SrDNA序列分属两个大类:泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota)。以Marine Crenarchaeotic GroupⅠ(古菌16S rDNA文库的49.2%)和Terrestrial Miscellaneous Euryarchaeotal Group(16.9%)为主要类群;其余为MarineBenthic Group B(9.7%)、Marine Benthic Group A(4%)、Marine Benthic Group D(1.6%)、Novel Euryarchaeotic Group(0.8%)和C3(0.8%)。细菌克隆子多样性明显高于古菌,16SrDNA序列分别来自变形杆菌(Proteobacteria)(细菌16S rDNA文库的30.5%)、浮霉菌(Planctomycetes)(20.3%)、放线菌(Actinobacteria)(14.4%)、厚壁菌(Firmicutes)(15.3%)、屈桡杆菌(Chloroflexi)(8.5%)、酸杆菌(Acidobacteria)(3.4%)、candidate divisionOP8(2.5%)、拟杆菌/绿菌(Bacterioidetes/Chlorobi)(1.7%)和疣微菌(Verrucomicrobia)(1.7%)。变形杆菌为优势类群(包括Alpha-和Delta-Proteobacteria亚群)。多数克隆子为未培养细菌和古菌。结果表明南海表层沉积物中蕴含大量未知的微生物资源。