南沙海区沉积物中细菌和古细菌16S rDNA多样性的研究

被引：20

作者：

许飞

戴欣

陈月琴

周惠

蔡剑华

屈良鹄

机构：

[1] 中山大学基因工程教育部重点实验室

[2] 中国科学院南海海洋研究所

[3] 中山大学基因工程教育部重点实验室广州

[4] 广州

来源：

海洋与湖沼 | 2004年 / 01期

基金：

广东省自然科学基金;

关键词：

南海; 海洋沉积物; 细菌; 古细菌; 多样性;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q912 [];

学科分类号：

0709 ; 070903 ;

摘要：

采用细菌 1 6SrDNA通用引物和PCR扩增等方法 ,构建了南海南沙海区沉积物 1 6SrDNA文库 ,并通过RFLP酶切分型对所获得的 70个克隆进行测序。从国际分子生物学数据库中调取相关序列 ,以PAUP4 0分析软件构建序列同源性矩阵和系统发育树图。结果表明 ,与细菌文库中克隆相似的微生物属于 4个细菌类群 :变形细菌 (Proteobacteria) (6 0 % )、革兰氏阳性细菌 (Gram positivebacteria) (1 3% )、浮霉菌 (Planctomycetes) (1 0 % )和无硫绿细菌 (Greennon sulfurbacteria) (6 % ) ,其中变形细菌 (包括δ 、γ 和α 变形细菌 )是明显的优势类群。采用Blast程序对所有序列基因数据库进行搜索 ,发现只有一个克隆与已知序列完全相似 ,说明文库具有极高的多样性。但是对古细菌文库中所获得的克隆子进行二级结构和序列特征分析的结果表明 ,这些克隆子均为海洋未获培养的细菌 ,因此在作者的文库中并未有古细菌的发现

引用

页码：89 / 94

页数：6

共 6 条

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