SSR-BSA技术对乌鳢性别差异标记的初步筛选

被引:13
作者
刘改艳 [1 ,2 ]
陈昆慈 [1 ]
郑光明 [1 ]
朱新平 [1 ]
赵建 [1 ]
徐鹏 [3 ]
孙效文 [4 ]
机构
[1] 中国水产科学研究院珠江水产研究所
[2] 上海海洋大学水产与生命学院
[3] 中国水产科学研究院
[4] 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
关键词
乌鳢; 微卫星; 性别差异; 混合分离群体法;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
0908 ;
摘要
采用SSR结合BSA技术对1个家系96个乌鳢个体(雌雄各48个)进行性别差异标记的筛选。首先构建了雌雄基因池(各24个个体),然后用140对微卫星引物对其进行扫描,发现3对引物(HLJWL17,HLJWL59,HLJWL70)在雌雄基因池间扩增出差异条带,且都出现在雌性基因池中。用构建基因池的48个个体对3对引物进行第一轮单个体验证,HLJWL17和HLJWL70在基因池中扩增出的差异条带仅在极个别个体中出现,而HLJWL59的差异条带在绝大多数的雌性个体中被成功扩增出来,雄性个体皆无。用其余的48个个体对HLJWL59进行第二轮单个体验证,得到同样结果。对HLJWL59在8个雌性个体中扩增出来的差异基因片段进行克隆并测序。将8个个体的测序结果用Vector 8.0进行多序列比对,证实各个个体得到的条带是同一序列,该序列长度为243 bp,以TGC为重复单位,GC含量为51%。通过BLASTn比对,发现在GenBank数据库中无同源性序列存在。经统计,此差异标记在雌性乌鳢中出现的概率为62.5%,即该标记对该家系乌鳢性别的正确判别率为81.25%。
引用
收藏
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页数:6
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