哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析

采用磁珠富集法构建哲罗鱼（Hucho taimenPallas）基因组微卫星文库。哲罗鱼基因组DNA经MboI限制性内切酶消化后,选取400～900 bp的片段,用生物素标记的简单重复序列（ACA）15作探针与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,获得目的片段,连接T载体克隆,构建基因组微卫星富集文库。再用同位素标记的（ACA）15探针进行二次筛选,筛选出686个阳性克隆,阳性克隆率为35.94%。对其中140个阳性克隆进行测序,共获得149个微卫星序列,4个小卫星序列,其GenBank Accession Number为DQ110955DQ121108。其中perfect（完美型）62个,占41.61%;imperfect（非完美型）92个,占61.74%;compound（混合型）5个,占3.36%,重复次数主要分布于6～45（81.21%）,平均重复次数为32.5,这表明（ACA/TGT）n在哲罗鱼基因组DNA中含量非常丰富。本研究旨为从DNA水平上研究哲罗鱼种群结构、遗传多样性及目前群体现状等方面提供有效工具。