目的对野生黄连进行遗传多样性研究。方法通过ISSR技术对7个野生黄连居群共78个个体进行遗传多样性分析。结果用12个随机引物共扩增出106条清晰条带,其中72条具多态性,平均多态性位点比率为67.92%,Nei′s基因多样性指数H=0.1803,Shannon多样性指数I=0.2832,遗传分化指数Gst=0.6815,遗传距离和遗传一致度分别为:0.0894~0.1846和0.8321~0.9127。结论黄连种水平上具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群间,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性,ISSR可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记。