2008年广东省肠道病毒71型分离株全基因组核苷酸序列分析

被引：10

作者：

ZHANG Xin

DENG Xiao-ling

GUAN Da-wei

ZHENG Huan-ying

GUO Xun

YANG Xing-fen

KE Chang-wen

机构：

[1] 广州

[2] 广东省疾病预防控制中心

来源：

中华微生物学和免疫学杂志 | 2009年 / 04期

关键词：

手足口病; 肠道病毒71型; 测序; 同源性分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

R [医药、卫生];

学科分类号：

10 ;

摘要：

目的了解2008年广东省流行的肠道病毒(EV)71型基因特征.方法选择2008年广东省分离的1株EV71毒株(GDFS-3),进行全基因组序列测定和基因进化特性的分析.结果 GDFS-3株与其他EV71型毒株相比,在编码区没有核苷酸的缺失和插入,其5''UTR和3''UTR的长度和序列有一定的差异.核苷酸同源性比较结果表明,GDFS-3株与中国台湾流行株(TW984)的同源性最高(为96.0%),与新加坡流行株SIN5865及标准株MS、BrCr的同源性则在81.0%左右.氨基酸同源性比较结果表明,GDFS-3株与TW984同源件最高(99.0%).根据VP1基因序列构建亲缘性关系树,GDFS-3株与C4亚型(subgenogroup)聚为一簇,与C4亚型代表株的核苷酸序列同源性为91.0%～95.0%.结论遗传进化分析表明,GDFS-3株和中国台湾2004年流行的EV71毒株的亲缘关系最为密切,属于C4亚型,而与标准株BrCr和MS的亲缘关系较远.5''UTR的突变对于EV71毒力增强可能有重要作用.上述结果有助于EV71型的基础研究和中国对于EV71所致疾病的预防。

引用