1970~2004年全球肠道病毒71型分离株的分子流行病学分析

被引:106
作者
董晓楠
应剑
陈应华
机构
[1] 清华大学生物科学与技术系分子免疫学实验室蛋白质科学教育部重点实验室
关键词
肠道病毒71型(EV71); VP1; 流行病学; 共变异;
D O I
暂无
中图分类号
R181.3 [流行病学各论];
学科分类号
摘要
人类肠道病毒71型(EV71)是引起手足口病的主要病原体,常导致严重的神经系统综合征.近年来病毒多爆发于亚太地区的热带区域.为研究人类肠道病毒的进化历程以及遗传变异性,搜集了全球在1970~2004年间分离的532株病毒的序列信息,这些信息包含了完整或接近完整的VP1区核苷酸序列(891bp).经过系统发生学分析以及遗传距离的比较,发现绝大多数病毒株属于基因型B或C.同时也观察到一种特殊的不属于任何现有分型的毒株R13223-IND-01,可能代表了一种新的基因型.在B型和C型病毒中,存在着一些区别于同型其他亚型毒株的“孤儿株”,它们的出现在病毒进化分析中有重要的意义.此外,VP1片段上有6个散在位点的氨基酸存在共变异的现象,分析发现这种高比例的共变异与病毒亚型有着紧密的联系.
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