扬子鳄SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选

被引:10
作者
田明礼
吴孝兵
机构
[1] 安徽师范大学生命科学学院
关键词
扬子鳄; SRAP标记; 引物; 反应体系;
D O I
10.14182/j.cnki.1001-2443.2008.02.008
中图分类号
Q78 [基因工程(遗传工程)];
学科分类号
071007 ; 0836 ; 090102 ;
摘要
以扬子鳄总DNA为材料,对影响SRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物浓度等因素进行了优化,分析了TaqDNA聚合酶、样本浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度以及引物浓度对SRAP-PCR扩增结果的影响.筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物l3对,建立了稳定的、可重复的扬子鳄SRAP-PCR最佳反应体系及PCR扩增参数.研究结果表明:在30μlSRAP-PCR反应体系中,样本最适宜为1μl(30ng/μl),Mg2+的最适为2μl(2.5mmol/L),dNTPs最适为2μl(2.5mmol/L),单引物的最适均为1μl(10pmol/μl);聚合酶在30μl反应体系中宜加入1U.SRAP-PCR引物筛选及其反应体系的建立,为今后利用SRAP标记技术开展扬子鳄种群的分子生物学研究提供了一个标准化程序和强有力的工具.
引用
收藏
页码:163 / 167
页数:5
相关论文
共 9 条
[1]   罗氏沼虾缅甸引进种和浙江本地种及其杂交种的生长性能与SRAP分析 [J].
周劲松 ;
曹哲明 ;
杨国梁 ;
李建林 ;
张志伟 ;
吴婷婷 .
中国水产科学, 2006, (04) :667-673
[2]   相关序列扩增多态性(SRAP)一种新的分子标记技术 [J].
任羽 ;
王得元 ;
张银东 .
中国农学通报, 2004, (06) :11-13+22
[3]   新型标记SRAP在棉花F2分离群体及遗传多样性评价中的适用性分析 [J].
林忠旭 ;
张献龙 ;
聂以春 .
遗传学报, 2004, (06) :622-626
[4]   扬子鳄种群的微卫星DNA多态及其遗传多样性保护对策分析 [J].
黄磊 ;
王义权 .
遗传学报, 2004, (02) :143-150
[5]   扬子鳄饲养种群线粒体DNA控制区的序列多态性 [J].
王义权 ;
朱伟铨 ;
王朝林 .
遗传学报, 2003, (05) :425-430
[6]  
Comparative analysis of seeded and vegetative biotype buffalograsses based on phylogenetic relationship using ISSRs, SSRs, RAPDs, and SRAPs[J] . H. Budak,R. C. Shearman,I. Parmaksiz,I. Dweikat.Theoretical and Applied Genetics . 2004 (2)
[7]   Gene for gene alignment between the Brassica and Arabidopsis genomes by direct transcriptome mapping [J].
Li, G ;
Gao, M ;
Yang, B ;
Quiros, CF .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 107 (01) :168-180
[8]   Genetic diversity of a germplasm collection of Cucurbita pepo using SRAP and AFLP markers [J].
Ferriol, M ;
Picó, B ;
Nuez, F .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 107 (02) :271-282
[9]  
Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J] . G. Li,C. F. Quiros.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2001 (2-3)