5个重庆地方猪种遗传多样性的微卫星分析

被引：13

作者：

白小青 ^{[1
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范首君 ^{[2
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王金勇 ^{[1
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刘文 ^{[1
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郭宗义 ^{[1
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何道领 ^{[2
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陈四清 ^{[1
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王可甜 ^{[1
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付文贵 ^{[1
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陈磊 ^{[1
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赵久刚 ^{[1
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蓝静 ^{[1
]}

张亮 ^{[1
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机构：

[1] 重庆市畜牧科学院

[2] 重庆市畜牧技术推广总站

来源：

畜牧兽医学报 | 2010年 / 12期

关键词：

地方猪种; 遗传多样性; 微卫星标记; 遗传距离; 聚类分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S828 [猪];

学科分类号：

0905 ;

摘要：

为了分析5个重庆地方猪种的遗传多样性和系统发生关系,采用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星标记,以有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数为指标,评估了品种内遗传变异。计算了F统计量、Nei氏遗传距离(DA)和Nei氏标准遗传距离(DS)并进行UPGMA和NJ聚类分析及主成分分析,进而探讨了品种间的遗传分化和亲缘关系。结果,27个微卫星座位共检测到542个等位基因,其中43个等位基因为单一品种所特有。5个猪种的遗传多样性丰富:有效等位基因数(Ne)在9.4933～11.0280之间,期望杂合度(He)在0.8897～0.9091之间,多态信息含量(PIC)在0.8689～0.8926之间。F统计量分析表明,重庆地方猪种遗传分化明显(P<0.001),各群体内存在一定程度的近交。2种聚类方法以NJ法更为可靠。5个猪种聚为两类,荣昌猪、渠溪猪和合川猪为一类,罗盘山猪和盆周山地猪为一类。相关性分析表明,遗传距离与地理距离间无显著的相关(P>0.05)。该研究结果为重庆地方猪种的保护和利用提供了重要的理论依据。

引用

页码：1515 / 1522

页数：8

共 4 条

[1] 56个中国地方猪种微卫星基因座的遗传多样性 [J].

张桂香 ;

王志刚 ;

孙飞舟 ;

陈伟生 ;

杨国义 ;

郭式健 ;

李拥军 ;

赵小丽 ;

张沅 ;

孙军 ;

樊斌 ;

杨述林 ;

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遗传学报, 2003, (03) :225-233

[2]

统计遗传学[M]. 科学出版社 , 顾万春著, 2004

[3]

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[4]

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