中国普通野生稻与栽培稻种SSR多样性的比较分析

被引：47

作者：

张晓丽 ^{[1
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郭辉 ^{[2
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王海岗 ^{[1
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吕建珍 ^{[3
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袁筱萍 ^{[3
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彭锁堂 ^{[1
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魏兴华 ^{[3
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机构：

[1] 山西农业大学

[2] 广西大学

[3] 中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室,浙江杭州

来源：

作物学报 | 2008年 / 04期

关键词：

普通野生稻; 栽培稻; 地方品种; 选育品种; 遗传多样性; 分子方差分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511.9 [野生稻];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

采用48对SSR引物对288份我国普通野生稻和栽培稻的遗传多样性进行比较分析。结果显示,共检测到505个等位基因,每个位点的等位基因数变幅为5～20,平均10.5个;平均Nei基因多样性指数(He)为0.731,变幅为0.384(RM409)～0.905(RM206)。普通野生稻遗传多样性高于栽培稻种,栽培稻等位基因数和平均Nei基因多样性指数分别为普通野生稻的70.2%和88.2%,其中,栽培稻地方品种和选育品种等位基因数分别为普通野生稻的65.4%和53.0%,选育品种等位基因数仅为地方品种的81.1%。AMOVA分析表明,总变异的10.3%是由于种间SSR遗传差异所引起的,不同SSR位点种间的分化程度不同,在0.7%～46.3%之间,有43个位点种间遗传分化达到显著水平,其中以RM427分化最为明显,达46.3%。聚类分析表明,中国普通野生稻总体偏粳,极少数广东、海南材料偏籼。

引用

页码：591 / 597

页数：7

共 14 条

[1] 中国水稻选育品种遗传多样性及其近50年变化趋势 [J].