海岛棉NBS类型抗病基因类似物的起源、多样性及进化

被引:19
作者
涂礼莉
张献龙
朱龙付
聂以春
郭小平
机构
[1] 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室武汉,武汉,武汉,武汉,武汉
关键词
NBS; 抗病基因类似物; 棉花; 多样性; 进化;
D O I
暂无
中图分类号
S435.62 [棉病虫害];
学科分类号
090401 ; 090402 ;
摘要
利用已克隆植物的R基因NBS序列中保守模体合成简并引物 ,以海岛棉品系Pima 90 (Gossypiumbarba dense)基因组DNA为模板进行PCR扩增 ,通过T A克隆、测序和序列比较分析共得到 31条RGAs ,其中 1 9条具有连续的ORF。利用海岛棉的 31条RGAs与GenBank中陆地棉种质系M 2 4 9(Gossypiumhirsutum)的RGAs进行了比较分析 ,RGAs可分为两大类 :其中第Ⅰ类全部为陆地棉的RGAs;第Ⅱ类分别包括了陆地棉和海岛棉的RGAs。同时对海岛棉RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析 ,表明海岛棉RGAs可分为TIR(DrosophilaTollorhumaninter leukinreceptor like)和non TIR两类 ,与前人所报道的R基因进化一致。对 1 9条具有连续ORF的RGAs进行了结构分析 ,结果表明它们包括P loop、Kin 2、“PLAL”及Meyers等所定义的RNBS A、B、C 3个模体。结果表明 ,可能海岛棉NBS类型抗病基因类似物和其他物种具有同样的起源和进化机制
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