南京地区戊型肝炎病毒基因型鉴定和变异分析

被引：15

作者：

程险峰

戴星

孟继鸿

张红梅

周镇先

丁福

梁久红

耿全林

机构：

[1] 东南大学医学院病原生物学与免疫学系,东南大学医学院附属中大医院皮肤科,东南大学医学院病原生物学与免疫学系,东南大学医学院病原生物学与免疫学系,东南大学医学院附属南京市第二医院检验科,东南大学医学院病原生物学与免疫学系,东南大学医学院病原生物学与免疫学系,东南大学医学院附属南京市第二医院检验科江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京,江苏南京

来源：

中国病毒学 | 2005年 / 05期

关键词：

戊型肝炎病毒; 基因型; 序列分析; 逆转录套式聚合酶链反应;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373.21 [];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

为了解南京地区戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)基因型的分布以及变异状况,本研究采用逆转录套式聚合酶反应(RT-nPCR)的方法检测南京地区40份急性散发性戊型肝炎患者的粪便标本,对PCR产物进行测序,利用生物信息学软件比较核苷酸的同源性、遗传距离,进行基因分型和变异分析。40份粪便标本中检测到14份阳性HEV、RNA,检出率为35%,基因分型均为HEV IV型,且分属2个不同的亚型;利用生物信息学软件对国内I型和IV型毒株加以比较,发现HEV IV型毒株比I型变异程度高,不同年份的HEV IV型毒株变异更大,有新的亚型出现,且变异有随时间推移而增大的趋势。

引用

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共 6 条

[1] 通用性引物RT-nPCR扩增不同基因型戊型肝炎病毒基因组的探讨 [J].