甘薯中NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及序列分析

被引：17

作者：

林巧玲 ^{[1
]}

曾会才 ^{[2
]}

机构：

[1] 广东海洋大学农学院

[2] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所

来源：

西北农业学报 | 2007年 / 02期

关键词：

甘薯; NBS-LRR同源序列; 抗病基因;

D O I：

暂无

中图分类号：

S531 [甘薯（红薯）];

学科分类号：

090104 [作物信息科学与技术];

摘要：

根据已知的NBS-LRR类抗病基因蛋白质的保守序列设计简并引物,用以扩增甘薯基因组中的抗病基因同源序列,获得一条大小约500 bp的扩增片段,克隆测序后得到20个NBS-LRR类抗病基因同源片段RGAS。其推导的氨基酸序列均具有P-loop、Kinase-2a和Kinase-3a及GLPL区等几个保守区,并且可分为TIR-NBS-LRR和non-TIR-NBS-LRR两个亚类。其中10个TIR亚类RGAS与已克隆的N、L6、M等抗病基因相应区段的氨基酸序列的同源性为21%-44%,而10个non-TIR亚类RGAS与已克隆的Prf、RPM1、RPS2等抗病基因相应区段的氨基酸序列的同源性为15%-46%。这些抗病基因同源片段(RGA)可做为分子标记筛选甘薯的抗病候选基因。

引用

页码：65 / 69

页数：5

共 9 条

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