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- [2] 医学分子病毒学.[M].金奇主编;.科学出版社.2001,
我国分离的肠道病毒71型(SHZH03病毒株)全基因组核苷酸序列分析
被引：38
作者：
周世力
李琳琳
何雅青
杨洪
喻子牛
金奇
机构：
[1] 华中农业大学生命科学技术学院,中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室,中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室,中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室,华中农业大学生命科学技术学院,中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室武汉中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室,北京,北京,北京,北京,武汉,北京
来源：
关键词：
肠道病毒71型;
核苷酸序列分析;
同源性分析;
D O I：
10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001592
中图分类号：
R346 [];
学科分类号：
摘要：
对肠道病毒 71型 (enterovirus 71 ,EV71 )中国 (深圳 )分离株SHZH0 3进行了全基因组 (未包括多聚腺苷尾 )74 0 6个碱基的核苷酸序列测定。结果表明 ,SHZH0 3株与其它肠道病毒 71型毒株相比 ,在编码区没有核苷酸的缺失和插入 ,其 5′UTR和 3′UTR区的长度和序列有一定的差异。核苷酸同源性比较结果表明 ,在P1区SHZH0 3株与SHZH98株、中国台湾流行株 (TW 2 0 86、TW 2 2 72 )的同源性较高 (分别为 92 .5 % ,90 .1 %和 87.9% ) ,与新加坡流行株SIN5 6 6 6、SIN5 86 5及标准株MS、BrCr的同源性则在 81 %左右 ,而与CoxsackievirusA1 6 (Cox .A1 6 )的同源性最低 (6 3.6 % )。氨基酸同源性比较结果表明 ,在P1区SHZH0 3株与Cox .A1 6的同源性最低 ,但在P2和P3区SHZH0 3株与Cox .A1 6的同源性最高。P1区的遗传进化分析表明 ,SHZH0 3株和中国台湾 1 998年流行的EV71毒株的亲缘关系较近 ,属于同一型 (genogroup) ,而与标准株BrCr和MS的亲缘关系较远。上述结果有助于肠道病毒71型的基础研究和中国对于EV71所致疾病的预防
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