极大螺旋藻藻胆蛋白α亚基基因的生物信息学分析(英文)

被引：4

作者：

刘士伟 ^{[1
]}

刘杰 ^{[2
]}

李博生 ^{[1
]}

机构：

[1] 北京林业大学生物科学与技术学院

[2] 北京林业大学螺旋藻研究所

来源：

AgriculturalScience&Technology | 2010年 / 11卷 / 04期

关键词：

藻胆蛋白; α亚基; 生物信息学;

D O I：

10.16175/j.cnki.1009-4229.2010.04.001

中图分类号：

Q943 [植物细胞遗传学];

学科分类号：

071007 ; 090102 ;

摘要：

[目的]对极大螺旋藻藻胆蛋白α亚基进行分析研究,为该蛋白的后续研究提供依据。[方法]用生物信息学分析方法对已经在GenBank上登录的极大螺旋藻藻胆蛋白的α亚基基因(GenBank AF441177)及其翻译的氨基酸序列进行了其组成和相关性质的分析、蛋白质信号肽预测、跨膜结构域的预测及亲水性/疏水性的测定,同时构建了分子进化树,对上述结果进行了分析和探讨。[结果]该蛋白的氨基酸组成丰富,不仅含18种必需氨基酸还含有含有甘氨酸、天冬氨酸等非必需氨基酸;对该蛋白信号肽和跨膜结构域分析表明,其属于胞内蛋白;对该蛋白的亲水性分析表明,其属于亲水性蛋白;进化树分析表明,该蛋白与节旋藻的同源性高,达99%～100%。[结论]该研究为α亚基和β亚基之间的关系和相互作用提供了一定依据。

引用

页码：86 / 89

页数：4

共 5 条

[1] 植物金属硫蛋白MT2的生物信息分析 [J].

江年 ;

茆灿泉 .

生物信息学, 2009, 7 (01) :1-4+8

[2] 木质素合成酶C3H基因的生物信息学分析 [J].

薛永常 ;

聂会忠 ;

刘长斌 .

生物信息学, 2009, 7 (01) :13-17

[3] 极大螺旋藻(Spirulina maxima)藻蓝蛋白基因的克隆及其同源性分析 [J].

于平 ;

岑沛霖 ;

励建荣 ;

秦松 .

科技通报, 2003, (06) :457-460

[4] 藻胆蛋白的提取纯化研究进展 [J].

郑江 .

食品科学, 2002, (11) :159-161

[5]

Isolation, crystallization, crystal structure analysis and refinement of allophycocyanin from the cyanobacterium Spirulina platensis at 2.3 ? resolution[J] . Journal of Molecular Biology . 1995 (2)

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