荔枝种质遗传多样性的SRAP分析

被引：37

作者：

昝逢刚 ^{[1
,2
]}

吴转娣 ^{[1
,2
]}

曾淇 ^{[1
,2
]}

张惠云 ^{[2
]}

李明芳 ^{[1
]}

郑学勤 ^{[1
]}

机构：

[1] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所

[2] 海南大学

来源：

分子植物育种 | 2009年 / 7卷 / 03期

关键词：

荔枝; SRAP标记; 遗传多样性;

D O I：

暂无

中图分类号：

S667.1 [荔枝];

学科分类号：

090201 ;

摘要：

为评价荔枝种质的遗传多样性,从88对SRAP引物中筛选出22对多态性高、稳定性好的引物,用于研究46个荔枝品种。每对引物组合产生6～19条谱带,其中多态性条带284条,占总带数的97.93%。46个种质的相似系数在0.469～0.838之间,平均相似系数为0.644。其中,秤砣与红荔的相似性系数最大,亲缘关系最近;小丁香与三月红、三月红与A13两对相似系数最小,亲缘关系最远。UPGMA聚类分析显示,在相似系数为0.644处46份荔枝供试品种被划分为4个类群,并且来源地相同的品种间亲缘关系较密切。22对多态性引物中,引物me7-em2在海垦18中扩增出1条特征谱带,引物me3-em7在水东中也扩增出1条特征谱带,而仅凭这1条特征带就可以将荔枝品种海垦18或水东与其它材料区别开来。这说明SRAP标记可用于荔枝的品种鉴定和群体遗传结构的研究。

引用

页码：562 / 568

页数：7

共 8 条

[1] 荔枝SRAP-PCR反应体系的优化 [J].

昝逢刚 ;

吴转娣 ;

曾淇 ;

张惠云 ;

李明芳 ;

郑学勤 .

基因组学与应用生物学, 2009, 28 (01) :132-136

[2] 荔枝基因组DNA的提取 [J].

李明芳 ;

郑学勤 .

生物技术通讯, 2004, (06) :591-592

[3] 陆地棉纤维品质遗传基础的分子标记剖析 [J].

贺道华 ;

林忠旭 ;

张献龙 ;

聂以春 ;

郭小平 .

棉花学报, 2004, (03) :131-136

[4] Molecular characterization of Buffalograss germplasm using sequence-related amplified polymorphism markers [J].

Budak, H ;

Shearman, RC ;

Parmaksiz, I ;

Gaussoin, RE ;

Riordan, TP ;

Dweikat, I .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2004, 108 (02) :328-334

[5] Gene for gene alignment between the Brassica and Arabidopsis genomes by direct transcriptome mapping [J].

Li, G ;

Gao, M ;

Yang, B ;

Quiros, CF .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 107 (01) :168-180

[6] Genetic diversity of some accessions of Cucurbita maxima from Spain using RAPD and SBAP markers [J].

Ferriol, M ;

Picó, MB ;

Nuez, F .

GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2003, 50 (03) :227-238

[7] Genetic diversity of a germplasm collection of Cucurbita pepo using SRAP and AFLP markers [J].

Ferriol, M ;

Picó, B ;

Nuez, F .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 107 (02) :271-282

[8]

Sequence-related amplified polymorphism （SRAP）, a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J] . G. Li,C. F. Quiros.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2001 (2-3)

← 1 →