新一代测序技术及其对水稻分子设计育种的影响

被引：17

作者：

周德贵 ^{[1
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赵琼一 ^{[2
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付崇允 ^{[1
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李宏 ^{[1
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蔡学飞 ^{[2
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罗达 ^{[2
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周少川 ^{[1
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机构：

[1] 广东省农业科学院水稻研究所

[2] 中国科学院上海植物生理生态研究所

来源：

分子植物育种 | 2008年 / 04期

关键词：

水稻; 新一代测序; 分子设计育种;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511 [稻];

学科分类号：

摘要：

本文概述了以边合成(或连接)边测序为特征的新一代测序技术的基本原理以及现有的Roche(454)GSFLXsequencer、Illumina genome analyzer(Solexa)、Applied Biosystems SOLiDsequencer、HeliScope Sequencer等4种新一代测序平台的发展历史、测序流程、优缺点和测序成本等,并展望了新技术的发展可能对以水稻为代表的农作物大规模分子设计育种产生的影响。本文还提出通过对水稻核心种质育种材料体系的全基因组测序,开发功能性分子标记和特异基因芯片,缩短将基础研究成果应用于实际育种生产的时间,为真正进入分子设计育种时代奠定基础。

引用

页码：619 / 630

页数：12

共 11 条

[1] 水稻核心种质的育种成效
周少川
李宏
黄道强
卢德城
赖穗春
周德贵
王志东
缪若维
李康活
[J]. 中国水稻科学, 2008, (01) : 51 - 56
[2] 水稻核心种质育种
周少川
李宏湖
黄道强
卢德城
[J]. 科技导报, 2005, (11) : 25 - 28
[3] Genetic variation in rice
Doi, Kazuyuki
Yasui, Hideshi
Yoshimura, Atsushi
[J]. CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY, 2008, 11 (02) : 144 - 148
[4] Sorting of small RNAs into Arabidopsis argonaute complexes is directed by the 5′ terminal nucleotide
Mi, Shijun
Cai, Tao
Hu, Yugang
Chen, Yemiao
Hodges, Emily
Ni, Fangrui
Wu, Liang
Li, Shan
Zhou, Huanyu
Long, Chengzu
Chen, She
Hannon, Gregory J.
Qi, Yijun
[J]. CELL, 2008, 133 (01) : 116 - 127
[5] Specificity of ARGONAUTE7-miR390 interaction and dual functionality in TAS3 trans-acting siRNA formation
Montgomery, Taiowa A.
Howell, Miya D.
Cuperus, Josh T.
Li, Dawei
Hansen, Jesse E.
Alexander, Amanda L.
Chapman, Elisabeth J.
Fahlgren, Noah
Allen, Edwards
Carrington, James C.
[J]. CELL, 2008, 133 (01) : 128 - 141
[6] Next-Generation Sequencing: The Race Is On[J] . Andreas von Bubnoff.Cell . 2008 (5)
[7] Dynamic regulation of nucleosome positioning in the human genome
Schones, Dustin E.
Cui, Kairong
Cuddapah, Suresh
Roh, Tae-Young
Barski, Artem
Wang, Zhibin
Wei, Gang
Zhao, Keji
[J]. CELL, 2008, 132 (05) : 887 - 898
[8] Fluorescent in situ sequencing on polymerase colonies
Mitra, RD
Shendure, J
Olejnik, J
Edyta-Krzymanska-Olejnik
Church, GM
[J]. ANALYTICAL BIOCHEMISTRY, 2003, 320 (01) : 55 - 65
[9] Improved performance of pyrosequencing using single-stranded DNA-binding protein
Ronaghi, M
[J]. ANALYTICAL BIOCHEMISTRY, 2000, 286 (02) : 282 - 288
[10] Single-molecule,motion-based DNA sequencing using RNA polymerase .2 William J.G,and Block S.M. Science . 2006

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