水貂白细胞介素-2基因的克隆与生物学信息分析

被引:2
作者
曾范利 [1 ]
刘畅 [2 ]
李艳芝 [3 ]
苏凤艳 [1 ,4 ]
李哲 [1 ]
宗颖 [1 ]
机构
[1] 吉林农业大学中药材学院
[2] 长春市动植物公园
[3] 吉林省伊通满族自治县畜牧工作总站
[4] 吉林省梅花鹿生产与产品应用研究室
关键词
水貂; IL-2基因; 克隆; 生物学信息;
D O I
10.13326/j.jea.2016.1138
中图分类号
S865.223 [];
学科分类号
090705 ;
摘要
根据Gen Bank中狐白细胞介素-2(IL-2)基因序列(AJ621188),设计合成1对引物,以水貂脾脏组织RNA为模板,采用RT-PCR技术扩增水貂IL-2基因。序列分析表明:水貂IL-2基因长468 bp,编码155个氨基酸,其中含21个氨基酸的信号肽和134个氨基酸的成熟多肽。IL-2蛋白分子质量为17.84 ku,等电点为4.65,含有4个与二硫键形成有关的半胱氨酸,1个糖基化位点,成熟肽含有3个α螺旋,5个β折叠区,9个β转角。同源性分析发现,水貂IL-2基因序列与Gen Ban K发表的21种IL-2基因核苷酸序列同源性为2.9%88.5%,氨基酸序列同源性为5.2%80.6%。水貂与Gene Bank中21种动物的IL-2基因序列分析和系统进化树分析表明,IL-2基因存在种属特异性。水貂IL-2基因的成功克隆,为进一步研究水貂IL-2基因生物学活性和应用奠定基础。
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