单细胞转录组测序技术新进展及其在造血系统研究中的应用

被引：6

作者：

杨子宁

郝莎

程涛

机构：

[1] 中国医学科学院&北京协和医学院血液病医院(血液学研究所)实验血液学国家重点实验室

来源：

中国科学:生命科学 | 2020年 / 50卷 / 03期

基金：

国家重点研发计划;

关键词：

单细胞; 异质性; 转录组; 高通量测序; 造血系统;

D O I：

暂无

中图分类号：

R331.2 [造血机能（网状内皮系统的机能）]; Q78 [基因工程（遗传工程）];

学科分类号：

071007 [遗传学]; 100117 [系统生物医学];

摘要：

单细胞测序技术凭借其能全面反映细胞群体异质性这一优势,近年来发展迅速.其中,单细胞转录组测序技术提供了在分子水平上对细胞作分类或表征的替代方法,在发育生物学、神经科学、血液学、免疫及癌症等研究领域均展示出了广泛的应用前景.本文总结了近年来单细胞转录组测序技术的主要发展趋势,并列举了该技术在造血系统中的应用.

引用

页码：287 / 295

页数：9

共 22 条

[1]

造血微环境研究进展与发展方向 [J].

程辉 ;

程涛 .

中国科学:生命科学, 2017, 47 (12) :1242-1252

[2]

造血干细胞功能异质性研究的“金标准”——单细胞移植技术的建立和优化 [J].

王晓芳 ;

董芳 ;

郝莎 ;

程涛 ;

Hideo Ema .

中国科学:生命科学, 2017, 47 (12) :1353-1362

[3]

造血干细胞异质性.[J].陈晨;郝莎;程涛;.中华血液学杂志.2015, 10

[4]

Hematopoietic Hierarchy – An Updated Roadmap.[J].Yifan Zhang;Shuai Gao;Jun Xia;Feng Liu.Trends in Cell Biology.2018, 12

[5]

Integrated Single-Cell Analysis Maps the Continuous Regulatory Landscape of Human Hematopoietic Differentiation [J].

Buenrostro, Jason D. ;

Corces, M. Ryan ;

Lareau, Caleb A. ;

Wu, Beijing ;

Schep, Alicia N. ;

Aryee, Martin J. ;

Majeti, Ravindra ;

Chang, Howard Y. ;

Greenleaf, William J. .

CELL, 2018, 173 (06) :1535-+

[6]

Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding [J].

Rosenberg, Alexander B. ;

Roco, Charles M. ;

Muscat, Richard A. ;

Kuchina, Anna ;

Sample, Paul ;

Yao, Zizhen ;

Graybuck, Lucas T. ;

Peeler, David J. ;

Mukherjee, Sumit ;

Chen, Wei ;

Pun, Suzie H. ;

Sellers, Drew L. ;

Tasic, Bosiljka ;

Seelig, Georg .

SCIENCE, 2018, 360 (6385) :176-+

[7]

Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq [J].

Han, Xiaoping ;

Wang, Renying ;

Zhou, Yincong ;

Fei, Lijiang ;

Sun, Huiyu ;

Lai, Shujing ;

Saadatpour, Assieh ;

Zhou, Zimin ;

Chen, Haide ;

Ye, Fang ;

Huang, Daosheng ;

Xu, Yang ;

Huang, Wentao ;

Jiang, Mengmeng ;

Jiang, Xinyi ;

Mao, Jie ;

Chen, Yao ;

Lu, Chenyu ;

Xie, Jin ;

Fang, Qun ;

Wang, Yibin ;

Yue, Rui ;

Li, Tiefeng ;

Huang, He ;

Orkin, Stuart H. ;

Yuan, Guo-Cheng ;

Chen, Ming ;

Guo, Guoji .

CELL, 2018, 172 (05) :1091-+

[8]

Spatial reconstruction of immune niches by combining photoactivatable reporters and scRNA-seq [J].

Medaglia, Chiara ;

Giladi, Amir ;

Stoler-Barak, Liat ;

De Giovanni, Marco ;

Salame, Tomer Meir ;

Biram, Adi ;

David, Eyal ;

Li, Hanjie ;

Iannacone, Matteo ;

Shulman, Ziv ;

Amit, Ido .

SCIENCE, 2017, 358 (6370) :1622-1626

[9]

Single-cell RNA-seq reveals new types of human blood dendritic cells, monocytes, and progenitors [J].

Villani, Alexandra-Chloe ;

Satija, Rahul ;

Reynolds, Gary ;

Sarkizova, Siranush ;

Shekhar, Karthik ;

Fletcher, James ;

Griesbeck, Morgane ;

Butler, Andrew ;

Zheng, Shiwei ;

Lazo, Suzan ;

Jardine, Laura ;

Dixon, David ;

Stephenson, Emily ;

Nilsson, Emil ;

Grundberg, Ida ;

McDonald, David ;

Filby, Andrew ;

Li, Weibo ;

De Jager, Philip L. ;

Rozenblatt-Rosen, Orit ;

Lane, Andrew A. ;

Haniffa, Muzlifah ;

Regev, Aviv ;

Hacohen, Nir .

SCIENCE, 2017, 356 (6335)

[10]

Understanding development and stem cells using single cell-based analyses of gene expression [J].

Kumar, Pavithra ;

Tan, Yuqi ;

Cahan, Patrick .

DEVELOPMENT, 2017, 144 (01) :17-32

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