2011年上海地区轻、重症手足口病患者肠道病毒71型分离株VP1、VP4区的基因特征分析

被引：9

作者：

蔡韵 ^{[1
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申惠国 ^{[2
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李治俊 ^{[2
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居丽雯 ^{[1
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蒋露芳 ^{[1
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熊海燕 ^{[1
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姜庆五 ^{[1
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机构：

[1] 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室

[2] 上海市闵行区疾病预防控制中心

来源：

中华传染病杂志 | 2013年 / 01期

关键词：

手足口病; 肠道病毒A型,人; 基因,病毒; 序列分析; 基因型; 变异(遗传学);

D O I：

暂无

中图分类号：

R72 [儿科学];

学科分类号：

100202 ;

摘要：

目的了解2011年上海地区手足口病重症和轻症患儿中肠道病毒71型(EV71)分离株VP1、VP4区的基因特征。方法对来自2011年重症与轻症手足口病患儿的各5株EV71分离株进行VP1、VP4全序列的RT-PCR扩增测序,并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71 A、B、C基因型代表株进行核苷酸、氨基酸比对分析和系统进化分析。结果轻、重症患儿的EV71分离株之间VP1基因的核苷酸同源性为96.0%～98.1%;VP4基因的核苷酸同源性为93.7%～99.5%。轻、重症患儿的EV71分离株与C基因型代表株比较接近,VP1区核苷酸同源性分别为86.9%～98.2%、87.4%～98.5%,VP4区核苷酸同源性分别为85.5%～100.0%、84.5%～99.5%,其中与2008年安徽省阜阳市的EV71流行株(C4亚型)VP1区核苷酸同源性分别可达97.0%～98.2%、97.9%～98.5%,V P4区核苷酸同源性分别可达96.1%～100.0%、97.1%～99.5%。3例重症患儿分离株在VP1和VP4的天冬酰胺(N)282丝氨酸(S)、苏氨酸(T)7丙氨酸(A)同时发生变异。结论 2011年上海地区10例轻、重症手足口病患儿中分离的EV71流行株均属C基因型的C4亚型;3例重症患儿分离株在VP1和VP4的N282S、T7A同时发生变异。

引用

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共 10 条

[1]

肠道病毒71型北京分离株VP4基因序列及蛋白抗原性分析.[J].李玉运;朱汝南;钱渊;邓洁;孙宇;王芳;赵林清;刘立颖;.病毒学报.2011, 03

[2] 长沙市2010年手足口病EV71型VP1区基因序列分析 [J].