用SSR标记检测杂交籼稻三系亲本的遗传差异

被引:6
作者
陈英 [1 ,2 ]
邱琳 [2 ]
涂升斌 [1 ]
栾丽 [1 ]
王兴 [1 ]
龙文波 [1 ]
机构
[1] 中国科学院成都生物研究所
[2] 中国科学院研究生院
关键词
SSR; 籼稻亲本; 遗传多样性; 聚类分析;
D O I
暂无
中图分类号
S511.21 [];
学科分类号
0901 ;
摘要
随机选用分布于水稻(Oryzasativa L.)12条染色体上的110对引物,共筛选出26对具有多态性的SSR引物,对24份杂交籼稻三系亲本材料进行遗传多样性和亲缘关系分析.全部24份亲本中共检测出116对等位基因,每个SSR引物可检测到的等位基因数目为2~7个不等,平均每对引物可以检测到4.4个等位基因.多态信息量(PIC)的变动范围为0.0689~0.8036,平均PIC值为0.6034;期望杂合度(He)的变动范围为0.0816~0.8298,平均值为0.6169;多样性指数(I)变幅为0.1732~1.7913,平均为1.1600.对供试亲本材料根据遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明,SSR微卫星标记可以将24份亲本材料分为3个大群,各组亲本间的遗传差异较大.通过分子标记辅助育种,可以有效地鉴定供试亲本材料之间的亲缘关系,分析预测新种质材料的遗传差异,可作为选育强优势组合杂交水稻的重要参考指标之一.图2表3参24
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